Protein–RNA interactions for Protein: P25425

Pou2f1, POU domain, class 2, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou2f1P25425 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pou2f1P25425 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pou2f1P25425 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pou2f1P25425 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pou2f1P25425 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pou2f1P25425 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pou2f1P25425 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pou2f1P25425 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pou2f1P25425 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pou2f1P25425 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pou2f1P25425 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Pou2f1P25425 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pou2f1P25425 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pou2f1P25425 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pou2f1P25425 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pou2f1P25425 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pou2f1P25425 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pou2f1P25425 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pou2f1P25425 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pou2f1P25425 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pou2f1P25425 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pou2f1P25425 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pou2f1P25425 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pou2f1P25425 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pou2f1P25425 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pou2f1P25425 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pou2f1P25425 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pou2f1P25425 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pou2f1P25425 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Pou2f1P25425 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pou2f1P25425 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pou2f1P25425 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pou2f1P25425 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Pou2f1P25425 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Pou2f1P25425 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pou2f1P25425 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Pou2f1P25425 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pou2f1P25425 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pou2f1P25425 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pou2f1P25425 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pou2f1P25425 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pou2f1P25425 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pou2f1P25425 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pou2f1P25425 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pou2f1P25425 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pou2f1P25425 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pou2f1P25425 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pou2f1P25425 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pou2f1P25425 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pou2f1P25425 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Pou2f1P25425 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pou2f1P25425 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pou2f1P25425 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Pou2f1P25425 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pou2f1P25425 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Pou2f1P25425 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pou2f1P25425 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pou2f1P25425 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pou2f1P25425 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Pou2f1P25425 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pou2f1P25425 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pou2f1P25425 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pou2f1P25425 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pou2f1P25425 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pou2f1P25425 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pou2f1P25425 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pou2f1P25425 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pou2f1P25425 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pou2f1P25425 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pou2f1P25425 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Pou2f1P25425 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pou2f1P25425 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pou2f1P25425 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pou2f1P25425 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pou2f1P25425 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pou2f1P25425 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pou2f1P25425 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pou2f1P25425 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pou2f1P25425 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pou2f1P25425 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Pou2f1P25425 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pou2f1P25425 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pou2f1P25425 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pou2f1P25425 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pou2f1P25425 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pou2f1P25425 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pou2f1P25425 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pou2f1P25425 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pou2f1P25425 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pou2f1P25425 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pou2f1P25425 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pou2f1P25425 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pou2f1P25425 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pou2f1P25425 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pou2f1P25425 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pou2f1P25425 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Pou2f1P25425 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pou2f1P25425 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pou2f1P25425 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pou2f1P25425 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 898.7 ms