Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ggta1P23336 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ggta1P23336 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ggta1P23336 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ggta1P23336 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ggta1P23336 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ggta1P23336 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ggta1P23336 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ggta1P23336 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ggta1P23336 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ggta1P23336 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ggta1P23336 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ggta1P23336 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ggta1P23336 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ggta1P23336 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ggta1P23336 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ggta1P23336 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ggta1P23336 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ggta1P23336 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ggta1P23336 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ggta1P23336 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ggta1P23336 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ggta1P23336 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ggta1P23336 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ggta1P23336 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Ggta1P23336 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Ggta1P23336 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ggta1P23336 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ggta1P23336 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ggta1P23336 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ggta1P23336 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ggta1P23336 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ggta1P23336 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ggta1P23336 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ggta1P23336 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ggta1P23336 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ggta1P23336 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ggta1P23336 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ggta1P23336 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Ggta1P23336 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ggta1P23336 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ggta1P23336 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ggta1P23336 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ggta1P23336 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ggta1P23336 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ggta1P23336 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ggta1P23336 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ggta1P23336 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ggta1P23336 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ggta1P23336 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ggta1P23336 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ggta1P23336 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ggta1P23336 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ggta1P23336 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ggta1P23336 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ggta1P23336 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ggta1P23336 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ggta1P23336 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ggta1P23336 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ggta1P23336 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ggta1P23336 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ggta1P23336 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Ggta1P23336 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ggta1P23336 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Ggta1P23336 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ggta1P23336 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ggta1P23336 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ggta1P23336 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ggta1P23336 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ggta1P23336 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ggta1P23336 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ggta1P23336 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ggta1P23336 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ggta1P23336 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ggta1P23336 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ggta1P23336 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ggta1P23336 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ggta1P23336 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ggta1P23336 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ggta1P23336 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ggta1P23336 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Ggta1P23336 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ggta1P23336 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ggta1P23336 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ggta1P23336 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ggta1P23336 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ggta1P23336 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ggta1P23336 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ggta1P23336 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ggta1P23336 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ggta1P23336 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ggta1P23336 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ggta1P23336 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ggta1P23336 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Ggta1P23336 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ggta1P23336 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ggta1P23336 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ggta1P23336 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ggta1P23336 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ggta1P23336 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.3 ms