Protein–RNA interactions for Protein: P20352

F3, Tissue factor, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F3P20352 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
F3P20352 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
F3P20352 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
F3P20352 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
F3P20352 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
F3P20352 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
F3P20352 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
F3P20352 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
F3P20352 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
F3P20352 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
F3P20352 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
F3P20352 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
F3P20352 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
F3P20352 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
F3P20352 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
F3P20352 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
F3P20352 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
F3P20352 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
F3P20352 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
F3P20352 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
F3P20352 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
F3P20352 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
F3P20352 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
F3P20352 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
F3P20352 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
F3P20352 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
F3P20352 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
F3P20352 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
F3P20352 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
F3P20352 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
F3P20352 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
F3P20352 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
F3P20352 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
F3P20352 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
F3P20352 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
F3P20352 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
F3P20352 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
F3P20352 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
F3P20352 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
F3P20352 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
F3P20352 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
F3P20352 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
F3P20352 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
F3P20352 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
F3P20352 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
F3P20352 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
F3P20352 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
F3P20352 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
F3P20352 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
F3P20352 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
F3P20352 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
F3P20352 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
F3P20352 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
F3P20352 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
F3P20352 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
F3P20352 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
F3P20352 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
F3P20352 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
F3P20352 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
F3P20352 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
F3P20352 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
F3P20352 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
F3P20352 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
F3P20352 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
F3P20352 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
F3P20352 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
F3P20352 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
F3P20352 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
F3P20352 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
F3P20352 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
F3P20352 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
F3P20352 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
F3P20352 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
F3P20352 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
F3P20352 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
F3P20352 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
F3P20352 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
F3P20352 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
F3P20352 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
F3P20352 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
F3P20352 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
F3P20352 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
F3P20352 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
F3P20352 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
F3P20352 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
F3P20352 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
F3P20352 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
F3P20352 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
F3P20352 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
F3P20352 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
F3P20352 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
F3P20352 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
F3P20352 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
F3P20352 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
F3P20352 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
F3P20352 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
F3P20352 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
F3P20352 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
F3P20352 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
F3P20352 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms