Protein–RNA interactions for Protein: P15331

Prph, Peripherin, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrphP15331 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PrphP15331 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PrphP15331 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PrphP15331 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PrphP15331 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PrphP15331 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PrphP15331 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PrphP15331 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PrphP15331 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PrphP15331 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PrphP15331 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PrphP15331 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PrphP15331 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PrphP15331 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PrphP15331 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PrphP15331 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PrphP15331 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PrphP15331 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PrphP15331 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PrphP15331 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PrphP15331 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PrphP15331 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PrphP15331 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PrphP15331 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PrphP15331 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PrphP15331 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PrphP15331 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PrphP15331 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PrphP15331 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PrphP15331 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PrphP15331 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PrphP15331 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PrphP15331 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PrphP15331 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PrphP15331 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PrphP15331 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PrphP15331 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PrphP15331 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PrphP15331 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PrphP15331 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PrphP15331 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PrphP15331 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PrphP15331 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PrphP15331 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PrphP15331 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PrphP15331 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PrphP15331 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PrphP15331 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PrphP15331 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PrphP15331 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PrphP15331 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PrphP15331 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PrphP15331 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PrphP15331 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PrphP15331 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PrphP15331 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PrphP15331 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PrphP15331 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PrphP15331 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PrphP15331 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PrphP15331 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PrphP15331 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PrphP15331 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PrphP15331 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PrphP15331 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PrphP15331 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PrphP15331 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PrphP15331 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PrphP15331 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PrphP15331 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PrphP15331 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PrphP15331 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PrphP15331 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PrphP15331 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PrphP15331 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PrphP15331 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PrphP15331 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PrphP15331 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PrphP15331 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PrphP15331 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
PrphP15331 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PrphP15331 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PrphP15331 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PrphP15331 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PrphP15331 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PrphP15331 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PrphP15331 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PrphP15331 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PrphP15331 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PrphP15331 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PrphP15331 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PrphP15331 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PrphP15331 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PrphP15331 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PrphP15331 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PrphP15331 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PrphP15331 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PrphP15331 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PrphP15331 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PrphP15331 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms