Protein–RNA interactions for Protein: P14097

Ccl4, C-C motif chemokine 4, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl4P14097 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccl4P14097 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccl4P14097 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccl4P14097 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccl4P14097 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccl4P14097 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccl4P14097 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccl4P14097 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccl4P14097 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccl4P14097 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccl4P14097 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccl4P14097 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccl4P14097 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccl4P14097 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccl4P14097 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccl4P14097 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccl4P14097 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccl4P14097 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccl4P14097 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccl4P14097 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccl4P14097 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccl4P14097 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccl4P14097 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ccl4P14097 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccl4P14097 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccl4P14097 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccl4P14097 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccl4P14097 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccl4P14097 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccl4P14097 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccl4P14097 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccl4P14097 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccl4P14097 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccl4P14097 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccl4P14097 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccl4P14097 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccl4P14097 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccl4P14097 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccl4P14097 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccl4P14097 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccl4P14097 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccl4P14097 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccl4P14097 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccl4P14097 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccl4P14097 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccl4P14097 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccl4P14097 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccl4P14097 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccl4P14097 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccl4P14097 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccl4P14097 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccl4P14097 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccl4P14097 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccl4P14097 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccl4P14097 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccl4P14097 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccl4P14097 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccl4P14097 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccl4P14097 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccl4P14097 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccl4P14097 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccl4P14097 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccl4P14097 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccl4P14097 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccl4P14097 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccl4P14097 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccl4P14097 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccl4P14097 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccl4P14097 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccl4P14097 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccl4P14097 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccl4P14097 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccl4P14097 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccl4P14097 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccl4P14097 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccl4P14097 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccl4P14097 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccl4P14097 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccl4P14097 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccl4P14097 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ccl4P14097 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccl4P14097 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccl4P14097 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccl4P14097 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccl4P14097 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccl4P14097 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccl4P14097 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccl4P14097 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccl4P14097 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccl4P14097 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccl4P14097 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccl4P14097 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccl4P14097 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccl4P14097 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccl4P14097 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccl4P14097 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccl4P14097 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccl4P14097 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccl4P14097 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccl4P14097 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms