Protein–RNA interactions for Protein: P09632

Hoxb8, Homeobox protein Hox-B8, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb8P09632 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Hoxb8P09632 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Hoxb8P09632 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Hoxb8P09632 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Hoxb8P09632 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Hoxb8P09632 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Hoxb8P09632 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Hoxb8P09632 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hoxb8P09632 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hoxb8P09632 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hoxb8P09632 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Hoxb8P09632 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hoxb8P09632 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hoxb8P09632 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hoxb8P09632 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Hoxb8P09632 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hoxb8P09632 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hoxb8P09632 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hoxb8P09632 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hoxb8P09632 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hoxb8P09632 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hoxb8P09632 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hoxb8P09632 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hoxb8P09632 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hoxb8P09632 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hoxb8P09632 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Hoxb8P09632 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Hoxb8P09632 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hoxb8P09632 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hoxb8P09632 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hoxb8P09632 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hoxb8P09632 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hoxb8P09632 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hoxb8P09632 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hoxb8P09632 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hoxb8P09632 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hoxb8P09632 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hoxb8P09632 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hoxb8P09632 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hoxb8P09632 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Hoxb8P09632 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hoxb8P09632 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hoxb8P09632 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hoxb8P09632 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hoxb8P09632 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hoxb8P09632 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hoxb8P09632 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hoxb8P09632 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hoxb8P09632 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Hoxb8P09632 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hoxb8P09632 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hoxb8P09632 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hoxb8P09632 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hoxb8P09632 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hoxb8P09632 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Hoxb8P09632 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hoxb8P09632 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hoxb8P09632 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hoxb8P09632 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hoxb8P09632 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hoxb8P09632 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hoxb8P09632 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hoxb8P09632 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hoxb8P09632 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Hoxb8P09632 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hoxb8P09632 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hoxb8P09632 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hoxb8P09632 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hoxb8P09632 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hoxb8P09632 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hoxb8P09632 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hoxb8P09632 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hoxb8P09632 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hoxb8P09632 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hoxb8P09632 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hoxb8P09632 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hoxb8P09632 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hoxb8P09632 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hoxb8P09632 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hoxb8P09632 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hoxb8P09632 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hoxb8P09632 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hoxb8P09632 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hoxb8P09632 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hoxb8P09632 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hoxb8P09632 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hoxb8P09632 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hoxb8P09632 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hoxb8P09632 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hoxb8P09632 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hoxb8P09632 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hoxb8P09632 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hoxb8P09632 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hoxb8P09632 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hoxb8P09632 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Hoxb8P09632 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hoxb8P09632 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hoxb8P09632 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hoxb8P09632 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hoxb8P09632 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms