Protein–RNA interactions for Protein: P09084

Pax1, Paired box protein Pax-1, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax1P09084 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pax1P09084 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pax1P09084 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pax1P09084 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pax1P09084 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pax1P09084 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pax1P09084 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pax1P09084 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pax1P09084 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pax1P09084 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pax1P09084 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pax1P09084 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pax1P09084 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pax1P09084 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pax1P09084 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pax1P09084 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pax1P09084 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pax1P09084 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pax1P09084 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pax1P09084 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pax1P09084 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pax1P09084 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pax1P09084 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pax1P09084 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pax1P09084 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pax1P09084 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pax1P09084 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pax1P09084 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pax1P09084 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pax1P09084 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pax1P09084 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pax1P09084 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Pax1P09084 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pax1P09084 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pax1P09084 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pax1P09084 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pax1P09084 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pax1P09084 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pax1P09084 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pax1P09084 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pax1P09084 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pax1P09084 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pax1P09084 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pax1P09084 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pax1P09084 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pax1P09084 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pax1P09084 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pax1P09084 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pax1P09084 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pax1P09084 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pax1P09084 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pax1P09084 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pax1P09084 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pax1P09084 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pax1P09084 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pax1P09084 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pax1P09084 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pax1P09084 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pax1P09084 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pax1P09084 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pax1P09084 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pax1P09084 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Pax1P09084 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pax1P09084 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pax1P09084 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pax1P09084 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Pax1P09084 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pax1P09084 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pax1P09084 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pax1P09084 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pax1P09084 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pax1P09084 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pax1P09084 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Pax1P09084 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pax1P09084 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pax1P09084 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Pax1P09084 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pax1P09084 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pax1P09084 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pax1P09084 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pax1P09084 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pax1P09084 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pax1P09084 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pax1P09084 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pax1P09084 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pax1P09084 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pax1P09084 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pax1P09084 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pax1P09084 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pax1P09084 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pax1P09084 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pax1P09084 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pax1P09084 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pax1P09084 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pax1P09084 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pax1P09084 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pax1P09084 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pax1P09084 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pax1P09084 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pax1P09084 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10 ms