Protein–RNA interactions for Protein: P04219

Putative uncharacterized Ig-region protein, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04219 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
P04219 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
P04219 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P04219 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
P04219 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P04219 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
P04219 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
P04219 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
P04219 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
P04219 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
P04219 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
P04219 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
P04219 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
P04219 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
P04219 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
P04219 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
P04219 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
P04219 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
P04219 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
P04219 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
P04219 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
P04219 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
P04219 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
P04219 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
P04219 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
P04219 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
P04219 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
P04219 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
P04219 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
P04219 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
P04219 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
P04219 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
P04219 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
P04219 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
P04219 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
P04219 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
P04219 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
P04219 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
P04219 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
P04219 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
P04219 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
P04219 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
P04219 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
P04219 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
P04219 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
P04219 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
P04219 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
P04219 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
P04219 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
P04219 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
P04219 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
P04219 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
P04219 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
P04219 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
P04219 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
P04219 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
P04219 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
P04219 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
P04219 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
P04219 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
P04219 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
P04219 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
P04219 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
P04219 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
P04219 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
P04219 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
P04219 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
P04219 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
P04219 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
P04219 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
P04219 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
P04219 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
P04219 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
P04219 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P04219 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P04219 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P04219 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P04219 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P04219 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P04219 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P04219 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P04219 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P04219 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P04219 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P04219 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P04219 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
P04219 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
P04219 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P04219 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P04219 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P04219 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
P04219 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P04219 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P04219 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P04219 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P04219 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P04219 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
P04219 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
P04219 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P04219 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms