Protein–RNA interactions for Protein: O88986

Gcat, 2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GcatO88986 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GcatO88986 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GcatO88986 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GcatO88986 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GcatO88986 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GcatO88986 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GcatO88986 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GcatO88986 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GcatO88986 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GcatO88986 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GcatO88986 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GcatO88986 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GcatO88986 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GcatO88986 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GcatO88986 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GcatO88986 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GcatO88986 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GcatO88986 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GcatO88986 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GcatO88986 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GcatO88986 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
GcatO88986 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GcatO88986 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GcatO88986 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GcatO88986 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GcatO88986 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GcatO88986 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GcatO88986 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GcatO88986 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
GcatO88986 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GcatO88986 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GcatO88986 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GcatO88986 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GcatO88986 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GcatO88986 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GcatO88986 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GcatO88986 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GcatO88986 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GcatO88986 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GcatO88986 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GcatO88986 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GcatO88986 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GcatO88986 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GcatO88986 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
GcatO88986 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GcatO88986 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GcatO88986 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GcatO88986 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GcatO88986 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GcatO88986 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GcatO88986 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GcatO88986 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GcatO88986 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GcatO88986 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GcatO88986 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GcatO88986 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GcatO88986 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GcatO88986 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GcatO88986 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GcatO88986 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GcatO88986 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GcatO88986 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GcatO88986 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GcatO88986 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GcatO88986 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GcatO88986 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GcatO88986 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GcatO88986 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GcatO88986 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GcatO88986 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GcatO88986 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GcatO88986 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GcatO88986 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GcatO88986 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GcatO88986 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GcatO88986 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GcatO88986 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
GcatO88986 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GcatO88986 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GcatO88986 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GcatO88986 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GcatO88986 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GcatO88986 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GcatO88986 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GcatO88986 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GcatO88986 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GcatO88986 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GcatO88986 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GcatO88986 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GcatO88986 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GcatO88986 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GcatO88986 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GcatO88986 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GcatO88986 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GcatO88986 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GcatO88986 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GcatO88986 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GcatO88986 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GcatO88986 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GcatO88986 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.4 ms