Protein–RNA interactions for Protein: O88532

Zfr, Zinc finger RNA-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,074 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZfrO88532 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZfrO88532 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZfrO88532 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZfrO88532 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZfrO88532 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZfrO88532 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZfrO88532 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZfrO88532 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZfrO88532 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZfrO88532 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ZfrO88532 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZfrO88532 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZfrO88532 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZfrO88532 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZfrO88532 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZfrO88532 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZfrO88532 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZfrO88532 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ZfrO88532 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZfrO88532 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZfrO88532 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZfrO88532 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZfrO88532 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZfrO88532 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZfrO88532 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZfrO88532 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ZfrO88532 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZfrO88532 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZfrO88532 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZfrO88532 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZfrO88532 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ZfrO88532 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ZfrO88532 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZfrO88532 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZfrO88532 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZfrO88532 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZfrO88532 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZfrO88532 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZfrO88532 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZfrO88532 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZfrO88532 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZfrO88532 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZfrO88532 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZfrO88532 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZfrO88532 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZfrO88532 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZfrO88532 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZfrO88532 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZfrO88532 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZfrO88532 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZfrO88532 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZfrO88532 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZfrO88532 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZfrO88532 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZfrO88532 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZfrO88532 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZfrO88532 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZfrO88532 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZfrO88532 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZfrO88532 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZfrO88532 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZfrO88532 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZfrO88532 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZfrO88532 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZfrO88532 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZfrO88532 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZfrO88532 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZfrO88532 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
ZfrO88532 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ZfrO88532 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZfrO88532 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZfrO88532 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZfrO88532 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZfrO88532 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZfrO88532 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZfrO88532 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZfrO88532 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZfrO88532 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZfrO88532 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZfrO88532 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZfrO88532 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZfrO88532 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZfrO88532 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZfrO88532 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZfrO88532 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZfrO88532 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZfrO88532 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ZfrO88532 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZfrO88532 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZfrO88532 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZfrO88532 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZfrO88532 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZfrO88532 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZfrO88532 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZfrO88532 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZfrO88532 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZfrO88532 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZfrO88532 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZfrO88532 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ZfrO88532 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms