Protein–RNA interactions for Protein: O88327

Ctnnal1, Alpha-catulin, mousemouse

Predictions only

Length 731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnal1O88327 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ctnnal1O88327 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ctnnal1O88327 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ctnnal1O88327 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ctnnal1O88327 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ctnnal1O88327 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ctnnal1O88327 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ctnnal1O88327 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ctnnal1O88327 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ctnnal1O88327 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ctnnal1O88327 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ctnnal1O88327 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ctnnal1O88327 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ctnnal1O88327 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ctnnal1O88327 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ctnnal1O88327 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ctnnal1O88327 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ctnnal1O88327 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ctnnal1O88327 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ctnnal1O88327 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ctnnal1O88327 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Ctnnal1O88327 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ctnnal1O88327 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ctnnal1O88327 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ctnnal1O88327 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ctnnal1O88327 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ctnnal1O88327 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ctnnal1O88327 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ctnnal1O88327 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ctnnal1O88327 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ctnnal1O88327 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ctnnal1O88327 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ctnnal1O88327 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ctnnal1O88327 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ctnnal1O88327 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ctnnal1O88327 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ctnnal1O88327 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Ctnnal1O88327 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ctnnal1O88327 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ctnnal1O88327 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ctnnal1O88327 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ctnnal1O88327 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ctnnal1O88327 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ctnnal1O88327 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ctnnal1O88327 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ctnnal1O88327 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ctnnal1O88327 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ctnnal1O88327 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ctnnal1O88327 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ctnnal1O88327 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ctnnal1O88327 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ctnnal1O88327 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ctnnal1O88327 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Ctnnal1O88327 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ctnnal1O88327 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ctnnal1O88327 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ctnnal1O88327 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ctnnal1O88327 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ctnnal1O88327 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ctnnal1O88327 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ctnnal1O88327 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ctnnal1O88327 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ctnnal1O88327 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ctnnal1O88327 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ctnnal1O88327 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ctnnal1O88327 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ctnnal1O88327 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ctnnal1O88327 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ctnnal1O88327 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ctnnal1O88327 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ctnnal1O88327 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ctnnal1O88327 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ctnnal1O88327 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ctnnal1O88327 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ctnnal1O88327 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ctnnal1O88327 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ctnnal1O88327 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ctnnal1O88327 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ctnnal1O88327 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ctnnal1O88327 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ctnnal1O88327 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ctnnal1O88327 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ctnnal1O88327 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ctnnal1O88327 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ctnnal1O88327 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ctnnal1O88327 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ctnnal1O88327 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ctnnal1O88327 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ctnnal1O88327 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ctnnal1O88327 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ctnnal1O88327 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ctnnal1O88327 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ctnnal1O88327 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ctnnal1O88327 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ctnnal1O88327 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ctnnal1O88327 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ctnnal1O88327 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ctnnal1O88327 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ctnnal1O88327 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ctnnal1O88327 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms