Protein–RNA interactions for Protein: O70238

Rhox6, Homeobox protein PSX, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox6O70238 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rhox6O70238 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rhox6O70238 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rhox6O70238 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rhox6O70238 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rhox6O70238 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rhox6O70238 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rhox6O70238 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rhox6O70238 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rhox6O70238 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rhox6O70238 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rhox6O70238 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rhox6O70238 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rhox6O70238 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rhox6O70238 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rhox6O70238 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rhox6O70238 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rhox6O70238 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rhox6O70238 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rhox6O70238 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rhox6O70238 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rhox6O70238 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rhox6O70238 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rhox6O70238 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rhox6O70238 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rhox6O70238 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rhox6O70238 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rhox6O70238 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Rhox6O70238 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rhox6O70238 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rhox6O70238 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rhox6O70238 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rhox6O70238 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rhox6O70238 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rhox6O70238 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rhox6O70238 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Rhox6O70238 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rhox6O70238 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rhox6O70238 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rhox6O70238 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rhox6O70238 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rhox6O70238 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rhox6O70238 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rhox6O70238 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rhox6O70238 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rhox6O70238 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rhox6O70238 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rhox6O70238 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rhox6O70238 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Rhox6O70238 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Rhox6O70238 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Rhox6O70238 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rhox6O70238 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rhox6O70238 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rhox6O70238 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rhox6O70238 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rhox6O70238 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rhox6O70238 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rhox6O70238 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rhox6O70238 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Rhox6O70238 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rhox6O70238 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rhox6O70238 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Rhox6O70238 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rhox6O70238 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rhox6O70238 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rhox6O70238 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rhox6O70238 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rhox6O70238 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rhox6O70238 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Rhox6O70238 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Rhox6O70238 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rhox6O70238 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rhox6O70238 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rhox6O70238 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rhox6O70238 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rhox6O70238 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rhox6O70238 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rhox6O70238 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rhox6O70238 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rhox6O70238 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rhox6O70238 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rhox6O70238 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rhox6O70238 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rhox6O70238 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Rhox6O70238 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rhox6O70238 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rhox6O70238 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rhox6O70238 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rhox6O70238 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rhox6O70238 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rhox6O70238 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rhox6O70238 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Rhox6O70238 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rhox6O70238 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rhox6O70238 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rhox6O70238 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rhox6O70238 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rhox6O70238 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rhox6O70238 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms