Protein–RNA interactions for Protein: O55222

Ilk, Integrin-linked protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IlkO55222 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IlkO55222 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IlkO55222 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IlkO55222 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IlkO55222 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IlkO55222 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IlkO55222 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IlkO55222 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IlkO55222 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IlkO55222 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IlkO55222 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IlkO55222 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IlkO55222 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IlkO55222 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IlkO55222 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IlkO55222 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IlkO55222 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IlkO55222 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IlkO55222 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IlkO55222 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IlkO55222 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IlkO55222 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IlkO55222 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IlkO55222 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IlkO55222 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IlkO55222 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IlkO55222 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IlkO55222 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IlkO55222 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IlkO55222 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IlkO55222 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IlkO55222 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IlkO55222 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IlkO55222 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
IlkO55222 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
IlkO55222 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IlkO55222 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
IlkO55222 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
IlkO55222 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IlkO55222 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IlkO55222 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IlkO55222 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IlkO55222 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
IlkO55222 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IlkO55222 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IlkO55222 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IlkO55222 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
IlkO55222 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
IlkO55222 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IlkO55222 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
IlkO55222 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
IlkO55222 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IlkO55222 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IlkO55222 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IlkO55222 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IlkO55222 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
IlkO55222 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IlkO55222 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IlkO55222 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IlkO55222 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IlkO55222 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
IlkO55222 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IlkO55222 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IlkO55222 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IlkO55222 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IlkO55222 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IlkO55222 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IlkO55222 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IlkO55222 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IlkO55222 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IlkO55222 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IlkO55222 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IlkO55222 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IlkO55222 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IlkO55222 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IlkO55222 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IlkO55222 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IlkO55222 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IlkO55222 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IlkO55222 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IlkO55222 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IlkO55222 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IlkO55222 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IlkO55222 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
IlkO55222 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IlkO55222 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IlkO55222 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IlkO55222 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IlkO55222 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IlkO55222 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IlkO55222 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IlkO55222 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IlkO55222 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IlkO55222 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IlkO55222 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IlkO55222 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IlkO55222 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IlkO55222 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IlkO55222 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IlkO55222 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.1 ms