Protein–RNA interactions for Protein: O55143

Atp2a2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2a2O55143 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atp2a2O55143 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atp2a2O55143 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atp2a2O55143 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atp2a2O55143 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atp2a2O55143 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atp2a2O55143 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atp2a2O55143 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atp2a2O55143 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atp2a2O55143 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atp2a2O55143 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atp2a2O55143 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atp2a2O55143 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atp2a2O55143 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atp2a2O55143 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atp2a2O55143 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atp2a2O55143 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atp2a2O55143 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atp2a2O55143 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atp2a2O55143 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atp2a2O55143 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atp2a2O55143 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atp2a2O55143 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atp2a2O55143 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atp2a2O55143 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atp2a2O55143 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atp2a2O55143 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atp2a2O55143 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atp2a2O55143 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atp2a2O55143 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atp2a2O55143 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atp2a2O55143 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atp2a2O55143 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atp2a2O55143 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atp2a2O55143 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atp2a2O55143 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atp2a2O55143 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atp2a2O55143 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atp2a2O55143 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atp2a2O55143 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atp2a2O55143 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Atp2a2O55143 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atp2a2O55143 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atp2a2O55143 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atp2a2O55143 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Atp2a2O55143 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atp2a2O55143 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atp2a2O55143 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atp2a2O55143 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atp2a2O55143 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atp2a2O55143 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atp2a2O55143 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atp2a2O55143 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atp2a2O55143 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atp2a2O55143 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Atp2a2O55143 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Atp2a2O55143 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atp2a2O55143 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atp2a2O55143 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atp2a2O55143 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Atp2a2O55143 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atp2a2O55143 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atp2a2O55143 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atp2a2O55143 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Atp2a2O55143 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atp2a2O55143 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atp2a2O55143 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atp2a2O55143 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atp2a2O55143 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atp2a2O55143 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atp2a2O55143 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atp2a2O55143 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atp2a2O55143 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Atp2a2O55143 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atp2a2O55143 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atp2a2O55143 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atp2a2O55143 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atp2a2O55143 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atp2a2O55143 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atp2a2O55143 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atp2a2O55143 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atp2a2O55143 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atp2a2O55143 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atp2a2O55143 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atp2a2O55143 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atp2a2O55143 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atp2a2O55143 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atp2a2O55143 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atp2a2O55143 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Atp2a2O55143 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atp2a2O55143 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atp2a2O55143 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atp2a2O55143 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atp2a2O55143 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atp2a2O55143 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Atp2a2O55143 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atp2a2O55143 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atp2a2O55143 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atp2a2O55143 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Atp2a2O55143 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.6 ms