Protein–RNA interactions for Protein: O55106

Strn, Striatin, mousemouse

Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StrnO55106 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
StrnO55106 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
StrnO55106 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
StrnO55106 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
StrnO55106 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
StrnO55106 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
StrnO55106 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
StrnO55106 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
StrnO55106 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
StrnO55106 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
StrnO55106 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
StrnO55106 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
StrnO55106 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
StrnO55106 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
StrnO55106 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
StrnO55106 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
StrnO55106 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
StrnO55106 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
StrnO55106 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
StrnO55106 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
StrnO55106 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
StrnO55106 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
StrnO55106 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
StrnO55106 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
StrnO55106 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
StrnO55106 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
StrnO55106 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
StrnO55106 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
StrnO55106 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
StrnO55106 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
StrnO55106 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
StrnO55106 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
StrnO55106 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
StrnO55106 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
StrnO55106 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
StrnO55106 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
StrnO55106 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
StrnO55106 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
StrnO55106 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
StrnO55106 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
StrnO55106 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
StrnO55106 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
StrnO55106 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
StrnO55106 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
StrnO55106 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
StrnO55106 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
StrnO55106 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
StrnO55106 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
StrnO55106 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
StrnO55106 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
StrnO55106 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
StrnO55106 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
StrnO55106 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
StrnO55106 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
StrnO55106 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
StrnO55106 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
StrnO55106 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
StrnO55106 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
StrnO55106 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
StrnO55106 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
StrnO55106 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
StrnO55106 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
StrnO55106 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
StrnO55106 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
StrnO55106 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
StrnO55106 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
StrnO55106 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
StrnO55106 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
StrnO55106 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
StrnO55106 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
StrnO55106 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
StrnO55106 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
StrnO55106 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
StrnO55106 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
StrnO55106 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
StrnO55106 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
StrnO55106 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
StrnO55106 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
StrnO55106 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
StrnO55106 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
StrnO55106 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
StrnO55106 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
StrnO55106 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
StrnO55106 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
StrnO55106 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
StrnO55106 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
StrnO55106 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
StrnO55106 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
StrnO55106 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
StrnO55106 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
StrnO55106 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
StrnO55106 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
StrnO55106 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
StrnO55106 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
StrnO55106 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
StrnO55106 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
StrnO55106 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
StrnO55106 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
StrnO55106 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
StrnO55106 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.9 ms