Protein–RNA interactions for Protein: O55013

Trappc3, Trafficking protein particle complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3O55013 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trappc3O55013 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trappc3O55013 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trappc3O55013 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trappc3O55013 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trappc3O55013 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trappc3O55013 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trappc3O55013 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trappc3O55013 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trappc3O55013 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trappc3O55013 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trappc3O55013 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trappc3O55013 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trappc3O55013 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trappc3O55013 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trappc3O55013 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trappc3O55013 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trappc3O55013 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trappc3O55013 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trappc3O55013 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trappc3O55013 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trappc3O55013 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trappc3O55013 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trappc3O55013 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trappc3O55013 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trappc3O55013 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trappc3O55013 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trappc3O55013 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trappc3O55013 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trappc3O55013 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trappc3O55013 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Trappc3O55013 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trappc3O55013 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trappc3O55013 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trappc3O55013 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trappc3O55013 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trappc3O55013 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trappc3O55013 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trappc3O55013 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trappc3O55013 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trappc3O55013 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trappc3O55013 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trappc3O55013 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trappc3O55013 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trappc3O55013 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trappc3O55013 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trappc3O55013 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trappc3O55013 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trappc3O55013 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trappc3O55013 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trappc3O55013 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trappc3O55013 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trappc3O55013 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trappc3O55013 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Trappc3O55013 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trappc3O55013 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trappc3O55013 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trappc3O55013 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trappc3O55013 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trappc3O55013 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Trappc3O55013 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trappc3O55013 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Trappc3O55013 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Trappc3O55013 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trappc3O55013 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Trappc3O55013 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trappc3O55013 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Trappc3O55013 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trappc3O55013 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Trappc3O55013 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trappc3O55013 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trappc3O55013 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trappc3O55013 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trappc3O55013 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trappc3O55013 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trappc3O55013 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trappc3O55013 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trappc3O55013 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trappc3O55013 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trappc3O55013 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trappc3O55013 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trappc3O55013 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trappc3O55013 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trappc3O55013 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trappc3O55013 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trappc3O55013 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trappc3O55013 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trappc3O55013 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trappc3O55013 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trappc3O55013 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trappc3O55013 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trappc3O55013 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trappc3O55013 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trappc3O55013 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trappc3O55013 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trappc3O55013 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trappc3O55013 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trappc3O55013 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trappc3O55013 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trappc3O55013 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms