Protein–RNA interactions for Protein: O35954

Pitpnm1, Membrane-associated phosphatidylinositol transfer protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitpnm1O35954 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pitpnm1O35954 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pitpnm1O35954 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pitpnm1O35954 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pitpnm1O35954 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Pitpnm1O35954 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pitpnm1O35954 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pitpnm1O35954 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pitpnm1O35954 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pitpnm1O35954 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pitpnm1O35954 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pitpnm1O35954 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pitpnm1O35954 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pitpnm1O35954 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pitpnm1O35954 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pitpnm1O35954 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pitpnm1O35954 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pitpnm1O35954 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pitpnm1O35954 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pitpnm1O35954 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pitpnm1O35954 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pitpnm1O35954 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pitpnm1O35954 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pitpnm1O35954 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pitpnm1O35954 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pitpnm1O35954 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pitpnm1O35954 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pitpnm1O35954 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pitpnm1O35954 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pitpnm1O35954 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pitpnm1O35954 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pitpnm1O35954 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pitpnm1O35954 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pitpnm1O35954 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pitpnm1O35954 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pitpnm1O35954 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pitpnm1O35954 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pitpnm1O35954 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pitpnm1O35954 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pitpnm1O35954 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pitpnm1O35954 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pitpnm1O35954 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pitpnm1O35954 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Pitpnm1O35954 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pitpnm1O35954 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pitpnm1O35954 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pitpnm1O35954 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pitpnm1O35954 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pitpnm1O35954 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Pitpnm1O35954 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pitpnm1O35954 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pitpnm1O35954 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pitpnm1O35954 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pitpnm1O35954 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pitpnm1O35954 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pitpnm1O35954 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pitpnm1O35954 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pitpnm1O35954 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pitpnm1O35954 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pitpnm1O35954 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pitpnm1O35954 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pitpnm1O35954 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pitpnm1O35954 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pitpnm1O35954 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pitpnm1O35954 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pitpnm1O35954 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pitpnm1O35954 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pitpnm1O35954 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Pitpnm1O35954 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pitpnm1O35954 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pitpnm1O35954 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pitpnm1O35954 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pitpnm1O35954 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pitpnm1O35954 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pitpnm1O35954 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pitpnm1O35954 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pitpnm1O35954 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pitpnm1O35954 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pitpnm1O35954 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pitpnm1O35954 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pitpnm1O35954 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pitpnm1O35954 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pitpnm1O35954 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pitpnm1O35954 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pitpnm1O35954 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pitpnm1O35954 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pitpnm1O35954 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pitpnm1O35954 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Pitpnm1O35954 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pitpnm1O35954 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pitpnm1O35954 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pitpnm1O35954 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pitpnm1O35954 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pitpnm1O35954 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pitpnm1O35954 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pitpnm1O35954 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pitpnm1O35954 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pitpnm1O35954 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pitpnm1O35954 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pitpnm1O35954 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms