Protein–RNA interactions for Protein: O35943

Fxn, Frataxin, mitochondrial, mousemouse

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FxnO35943 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FxnO35943 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FxnO35943 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FxnO35943 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FxnO35943 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FxnO35943 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FxnO35943 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FxnO35943 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FxnO35943 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
FxnO35943 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FxnO35943 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
FxnO35943 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
FxnO35943 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FxnO35943 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FxnO35943 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FxnO35943 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FxnO35943 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FxnO35943 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
FxnO35943 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FxnO35943 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FxnO35943 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FxnO35943 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FxnO35943 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FxnO35943 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FxnO35943 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FxnO35943 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FxnO35943 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
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FxnO35943 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FxnO35943 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FxnO35943 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FxnO35943 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FxnO35943 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FxnO35943 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
FxnO35943 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FxnO35943 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FxnO35943 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FxnO35943 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FxnO35943 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FxnO35943 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FxnO35943 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
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FxnO35943 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
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FxnO35943 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FxnO35943 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FxnO35943 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FxnO35943 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
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FxnO35943 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FxnO35943 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FxnO35943 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
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FxnO35943 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FxnO35943 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
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FxnO35943 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FxnO35943 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FxnO35943 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FxnO35943 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FxnO35943 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FxnO35943 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FxnO35943 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
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FxnO35943 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FxnO35943 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FxnO35943 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FxnO35943 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FxnO35943 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FxnO35943 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FxnO35943 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FxnO35943 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FxnO35943 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FxnO35943 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FxnO35943 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FxnO35943 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FxnO35943 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FxnO35943 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FxnO35943 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FxnO35943 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FxnO35943 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms