Protein–RNA interactions for Protein: O08583

Alyref, THO complex subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlyrefO08583 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AlyrefO08583 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AlyrefO08583 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AlyrefO08583 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AlyrefO08583 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AlyrefO08583 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AlyrefO08583 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AlyrefO08583 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AlyrefO08583 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AlyrefO08583 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AlyrefO08583 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AlyrefO08583 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AlyrefO08583 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AlyrefO08583 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AlyrefO08583 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AlyrefO08583 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AlyrefO08583 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AlyrefO08583 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AlyrefO08583 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AlyrefO08583 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AlyrefO08583 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AlyrefO08583 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AlyrefO08583 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AlyrefO08583 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AlyrefO08583 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AlyrefO08583 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AlyrefO08583 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AlyrefO08583 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AlyrefO08583 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AlyrefO08583 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AlyrefO08583 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AlyrefO08583 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AlyrefO08583 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AlyrefO08583 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AlyrefO08583 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
AlyrefO08583 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AlyrefO08583 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AlyrefO08583 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
AlyrefO08583 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AlyrefO08583 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AlyrefO08583 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AlyrefO08583 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AlyrefO08583 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
AlyrefO08583 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AlyrefO08583 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AlyrefO08583 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AlyrefO08583 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AlyrefO08583 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AlyrefO08583 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AlyrefO08583 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AlyrefO08583 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AlyrefO08583 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AlyrefO08583 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AlyrefO08583 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AlyrefO08583 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AlyrefO08583 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AlyrefO08583 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AlyrefO08583 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AlyrefO08583 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AlyrefO08583 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AlyrefO08583 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AlyrefO08583 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
AlyrefO08583 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AlyrefO08583 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AlyrefO08583 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AlyrefO08583 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
AlyrefO08583 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AlyrefO08583 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
AlyrefO08583 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
AlyrefO08583 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
AlyrefO08583 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AlyrefO08583 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AlyrefO08583 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AlyrefO08583 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AlyrefO08583 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AlyrefO08583 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AlyrefO08583 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AlyrefO08583 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AlyrefO08583 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AlyrefO08583 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AlyrefO08583 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AlyrefO08583 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AlyrefO08583 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AlyrefO08583 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AlyrefO08583 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AlyrefO08583 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AlyrefO08583 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AlyrefO08583 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AlyrefO08583 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AlyrefO08583 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
AlyrefO08583 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AlyrefO08583 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AlyrefO08583 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AlyrefO08583 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AlyrefO08583 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AlyrefO08583 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AlyrefO08583 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AlyrefO08583 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AlyrefO08583 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AlyrefO08583 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms