Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sec22bO08547 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sec22bO08547 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sec22bO08547 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Sec22bO08547 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sec22bO08547 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sec22bO08547 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sec22bO08547 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sec22bO08547 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sec22bO08547 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sec22bO08547 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sec22bO08547 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sec22bO08547 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sec22bO08547 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sec22bO08547 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sec22bO08547 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sec22bO08547 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sec22bO08547 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sec22bO08547 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sec22bO08547 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sec22bO08547 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sec22bO08547 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sec22bO08547 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sec22bO08547 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sec22bO08547 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sec22bO08547 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sec22bO08547 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sec22bO08547 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sec22bO08547 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sec22bO08547 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sec22bO08547 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sec22bO08547 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sec22bO08547 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sec22bO08547 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sec22bO08547 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sec22bO08547 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sec22bO08547 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Sec22bO08547 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sec22bO08547 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sec22bO08547 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sec22bO08547 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sec22bO08547 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sec22bO08547 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sec22bO08547 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sec22bO08547 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sec22bO08547 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sec22bO08547 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Sec22bO08547 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sec22bO08547 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sec22bO08547 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sec22bO08547 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sec22bO08547 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sec22bO08547 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sec22bO08547 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sec22bO08547 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Sec22bO08547 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sec22bO08547 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sec22bO08547 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sec22bO08547 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sec22bO08547 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sec22bO08547 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sec22bO08547 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sec22bO08547 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sec22bO08547 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sec22bO08547 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sec22bO08547 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sec22bO08547 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sec22bO08547 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sec22bO08547 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sec22bO08547 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sec22bO08547 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sec22bO08547 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sec22bO08547 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sec22bO08547 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sec22bO08547 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Sec22bO08547 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Sec22bO08547 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Sec22bO08547 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sec22bO08547 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sec22bO08547 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sec22bO08547 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sec22bO08547 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sec22bO08547 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sec22bO08547 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sec22bO08547 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sec22bO08547 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sec22bO08547 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sec22bO08547 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sec22bO08547 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sec22bO08547 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sec22bO08547 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sec22bO08547 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sec22bO08547 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sec22bO08547 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Sec22bO08547 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sec22bO08547 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sec22bO08547 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Sec22bO08547 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sec22bO08547 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sec22bO08547 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.2 ms