Protein–RNA interactions for Protein: J3QNM1

Cldn34c2, Claudin 34C2, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c2J3QNM1 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cldn34c2J3QNM1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cldn34c2J3QNM1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cldn34c2J3QNM1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cldn34c2J3QNM1 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cldn34c2J3QNM1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cldn34c2J3QNM1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cldn34c2J3QNM1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cldn34c2J3QNM1 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cldn34c2J3QNM1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cldn34c2J3QNM1 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cldn34c2J3QNM1 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cldn34c2J3QNM1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cldn34c2J3QNM1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cldn34c2J3QNM1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cldn34c2J3QNM1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cldn34c2J3QNM1 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cldn34c2J3QNM1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cldn34c2J3QNM1 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cldn34c2J3QNM1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cldn34c2J3QNM1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Cldn34c2J3QNM1 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cldn34c2J3QNM1 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cldn34c2J3QNM1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cldn34c2J3QNM1 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cldn34c2J3QNM1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cldn34c2J3QNM1 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cldn34c2J3QNM1 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cldn34c2J3QNM1 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cldn34c2J3QNM1 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cldn34c2J3QNM1 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Cldn34c2J3QNM1 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cldn34c2J3QNM1 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cldn34c2J3QNM1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cldn34c2J3QNM1 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cldn34c2J3QNM1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cldn34c2J3QNM1 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cldn34c2J3QNM1 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cldn34c2J3QNM1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cldn34c2J3QNM1 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Cldn34c2J3QNM1 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Cldn34c2J3QNM1 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cldn34c2J3QNM1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cldn34c2J3QNM1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Cldn34c2J3QNM1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cldn34c2J3QNM1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cldn34c2J3QNM1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cldn34c2J3QNM1 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cldn34c2J3QNM1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cldn34c2J3QNM1 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cldn34c2J3QNM1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cldn34c2J3QNM1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cldn34c2J3QNM1 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cldn34c2J3QNM1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cldn34c2J3QNM1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cldn34c2J3QNM1 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cldn34c2J3QNM1 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cldn34c2J3QNM1 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cldn34c2J3QNM1 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cldn34c2J3QNM1 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cldn34c2J3QNM1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cldn34c2J3QNM1 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cldn34c2J3QNM1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cldn34c2J3QNM1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cldn34c2J3QNM1 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cldn34c2J3QNM1 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cldn34c2J3QNM1 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cldn34c2J3QNM1 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cldn34c2J3QNM1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cldn34c2J3QNM1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cldn34c2J3QNM1 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cldn34c2J3QNM1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cldn34c2J3QNM1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cldn34c2J3QNM1 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Cldn34c2J3QNM1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cldn34c2J3QNM1 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cldn34c2J3QNM1 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cldn34c2J3QNM1 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cldn34c2J3QNM1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cldn34c2J3QNM1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Cldn34c2J3QNM1 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cldn34c2J3QNM1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cldn34c2J3QNM1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cldn34c2J3QNM1 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cldn34c2J3QNM1 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cldn34c2J3QNM1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cldn34c2J3QNM1 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cldn34c2J3QNM1 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cldn34c2J3QNM1 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cldn34c2J3QNM1 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cldn34c2J3QNM1 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cldn34c2J3QNM1 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Cldn34c2J3QNM1 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cldn34c2J3QNM1 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cldn34c2J3QNM1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cldn34c2J3QNM1 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cldn34c2J3QNM1 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cldn34c2J3QNM1 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cldn34c2J3QNM1 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cldn34c2J3QNM1 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms