Protein–RNA interactions for Protein: F6VLK5

Gm10722, Predicted gene 10722, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10722F6VLK5 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm10722F6VLK5 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm10722F6VLK5 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm10722F6VLK5 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm10722F6VLK5 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm10722F6VLK5 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm10722F6VLK5 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm10722F6VLK5 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm10722F6VLK5 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm10722F6VLK5 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm10722F6VLK5 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm10722F6VLK5 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm10722F6VLK5 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm10722F6VLK5 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm10722F6VLK5 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm10722F6VLK5 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm10722F6VLK5 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm10722F6VLK5 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm10722F6VLK5 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm10722F6VLK5 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm10722F6VLK5 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm10722F6VLK5 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm10722F6VLK5 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm10722F6VLK5 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm10722F6VLK5 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm10722F6VLK5 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm10722F6VLK5 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm10722F6VLK5 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm10722F6VLK5 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm10722F6VLK5 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm10722F6VLK5 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Gm10722F6VLK5 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Gm10722F6VLK5 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm10722F6VLK5 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm10722F6VLK5 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm10722F6VLK5 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm10722F6VLK5 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm10722F6VLK5 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm10722F6VLK5 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm10722F6VLK5 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm10722F6VLK5 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm10722F6VLK5 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm10722F6VLK5 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm10722F6VLK5 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm10722F6VLK5 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm10722F6VLK5 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm10722F6VLK5 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm10722F6VLK5 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm10722F6VLK5 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm10722F6VLK5 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm10722F6VLK5 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm10722F6VLK5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm10722F6VLK5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm10722F6VLK5 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm10722F6VLK5 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm10722F6VLK5 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm10722F6VLK5 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm10722F6VLK5 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm10722F6VLK5 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm10722F6VLK5 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm10722F6VLK5 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm10722F6VLK5 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm10722F6VLK5 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm10722F6VLK5 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm10722F6VLK5 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm10722F6VLK5 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm10722F6VLK5 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm10722F6VLK5 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm10722F6VLK5 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm10722F6VLK5 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm10722F6VLK5 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm10722F6VLK5 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm10722F6VLK5 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm10722F6VLK5 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm10722F6VLK5 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm10722F6VLK5 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm10722F6VLK5 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm10722F6VLK5 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm10722F6VLK5 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm10722F6VLK5 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gm10722F6VLK5 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm10722F6VLK5 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm10722F6VLK5 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm10722F6VLK5 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm10722F6VLK5 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm10722F6VLK5 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm10722F6VLK5 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm10722F6VLK5 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm10722F6VLK5 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm10722F6VLK5 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm10722F6VLK5 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm10722F6VLK5 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm10722F6VLK5 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm10722F6VLK5 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm10722F6VLK5 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm10722F6VLK5 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm10722F6VLK5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm10722F6VLK5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm10722F6VLK5 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm10722F6VLK5 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms