Protein–RNA interactions for Protein: F6UCX4

Sptbn5, Spectrin beta, non-erythrocytic 5 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn5F6UCX4 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Sptbn5F6UCX4 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Sptbn5F6UCX4 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Sptbn5F6UCX4 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Sptbn5F6UCX4 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Sptbn5F6UCX4 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Sptbn5F6UCX4 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Sptbn5F6UCX4 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Sptbn5F6UCX4 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Sptbn5F6UCX4 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Sptbn5F6UCX4 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Sptbn5F6UCX4 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Sptbn5F6UCX4 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Sptbn5F6UCX4 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Sptbn5F6UCX4 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Sptbn5F6UCX4 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Sptbn5F6UCX4 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Sptbn5F6UCX4 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Sptbn5F6UCX4 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Sptbn5F6UCX4 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Sptbn5F6UCX4 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Sptbn5F6UCX4 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Sptbn5F6UCX4 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Sptbn5F6UCX4 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Sptbn5F6UCX4 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Sptbn5F6UCX4 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Sptbn5F6UCX4 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Sptbn5F6UCX4 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Sptbn5F6UCX4 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Sptbn5F6UCX4 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Sptbn5F6UCX4 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
Sptbn5F6UCX4 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Sptbn5F6UCX4 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Sptbn5F6UCX4 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Sptbn5F6UCX4 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Sptbn5F6UCX4 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Sptbn5F6UCX4 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Sptbn5F6UCX4 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Sptbn5F6UCX4 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Sptbn5F6UCX4 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Sptbn5F6UCX4 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Sptbn5F6UCX4 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Sptbn5F6UCX4 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Sptbn5F6UCX4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Sptbn5F6UCX4 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Sptbn5F6UCX4 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Sptbn5F6UCX4 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Sptbn5F6UCX4 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Sptbn5F6UCX4 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Sptbn5F6UCX4 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Sptbn5F6UCX4 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Sptbn5F6UCX4 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Sptbn5F6UCX4 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Sptbn5F6UCX4 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Sptbn5F6UCX4 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Sptbn5F6UCX4 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Sptbn5F6UCX4 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Sptbn5F6UCX4 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Sptbn5F6UCX4 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Sptbn5F6UCX4 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Sptbn5F6UCX4 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Sptbn5F6UCX4 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Sptbn5F6UCX4 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Sptbn5F6UCX4 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Sptbn5F6UCX4 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Sptbn5F6UCX4 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Sptbn5F6UCX4 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Sptbn5F6UCX4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Sptbn5F6UCX4 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Sptbn5F6UCX4 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Sptbn5F6UCX4 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sptbn5F6UCX4 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sptbn5F6UCX4 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sptbn5F6UCX4 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sptbn5F6UCX4 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sptbn5F6UCX4 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Sptbn5F6UCX4 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Sptbn5F6UCX4 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Sptbn5F6UCX4 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Sptbn5F6UCX4 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Sptbn5F6UCX4 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Sptbn5F6UCX4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Sptbn5F6UCX4 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Sptbn5F6UCX4 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Sptbn5F6UCX4 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Sptbn5F6UCX4 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Sptbn5F6UCX4 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Sptbn5F6UCX4 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Sptbn5F6UCX4 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Sptbn5F6UCX4 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Sptbn5F6UCX4 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Sptbn5F6UCX4 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Sptbn5F6UCX4 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Sptbn5F6UCX4 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Sptbn5F6UCX4 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Sptbn5F6UCX4 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Sptbn5F6UCX4 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Sptbn5F6UCX4 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Sptbn5F6UCX4 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Sptbn5F6UCX4 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms