Protein–RNA interactions for Protein: F6U8B9

Gm17555, Predicted gene, 17555, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17555F6U8B9 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm17555F6U8B9 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm17555F6U8B9 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm17555F6U8B9 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm17555F6U8B9 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm17555F6U8B9 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm17555F6U8B9 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Gm17555F6U8B9 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm17555F6U8B9 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm17555F6U8B9 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm17555F6U8B9 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm17555F6U8B9 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm17555F6U8B9 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm17555F6U8B9 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm17555F6U8B9 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm17555F6U8B9 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm17555F6U8B9 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm17555F6U8B9 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm17555F6U8B9 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm17555F6U8B9 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm17555F6U8B9 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm17555F6U8B9 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm17555F6U8B9 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm17555F6U8B9 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm17555F6U8B9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm17555F6U8B9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm17555F6U8B9 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm17555F6U8B9 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm17555F6U8B9 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm17555F6U8B9 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm17555F6U8B9 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm17555F6U8B9 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm17555F6U8B9 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm17555F6U8B9 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm17555F6U8B9 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm17555F6U8B9 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm17555F6U8B9 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm17555F6U8B9 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm17555F6U8B9 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm17555F6U8B9 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm17555F6U8B9 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm17555F6U8B9 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm17555F6U8B9 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm17555F6U8B9 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm17555F6U8B9 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm17555F6U8B9 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm17555F6U8B9 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm17555F6U8B9 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm17555F6U8B9 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm17555F6U8B9 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm17555F6U8B9 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm17555F6U8B9 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm17555F6U8B9 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm17555F6U8B9 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm17555F6U8B9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm17555F6U8B9 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm17555F6U8B9 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm17555F6U8B9 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm17555F6U8B9 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm17555F6U8B9 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm17555F6U8B9 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm17555F6U8B9 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm17555F6U8B9 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm17555F6U8B9 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm17555F6U8B9 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm17555F6U8B9 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm17555F6U8B9 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm17555F6U8B9 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm17555F6U8B9 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm17555F6U8B9 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm17555F6U8B9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm17555F6U8B9 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm17555F6U8B9 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm17555F6U8B9 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm17555F6U8B9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm17555F6U8B9 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm17555F6U8B9 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm17555F6U8B9 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm17555F6U8B9 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm17555F6U8B9 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm17555F6U8B9 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm17555F6U8B9 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm17555F6U8B9 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm17555F6U8B9 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm17555F6U8B9 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm17555F6U8B9 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm17555F6U8B9 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm17555F6U8B9 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm17555F6U8B9 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm17555F6U8B9 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm17555F6U8B9 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm17555F6U8B9 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm17555F6U8B9 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm17555F6U8B9 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm17555F6U8B9 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm17555F6U8B9 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm17555F6U8B9 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm17555F6U8B9 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm17555F6U8B9 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm17555F6U8B9 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms