Protein–RNA interactions for Protein: F6SEU4

Syngap1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngap1F6SEU4 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Syngap1F6SEU4 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Syngap1F6SEU4 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Syngap1F6SEU4 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Syngap1F6SEU4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Syngap1F6SEU4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Syngap1F6SEU4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Syngap1F6SEU4 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Syngap1F6SEU4 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Syngap1F6SEU4 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Syngap1F6SEU4 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Syngap1F6SEU4 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Syngap1F6SEU4 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Syngap1F6SEU4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Syngap1F6SEU4 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Syngap1F6SEU4 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Syngap1F6SEU4 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Syngap1F6SEU4 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Syngap1F6SEU4 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Syngap1F6SEU4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Syngap1F6SEU4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Syngap1F6SEU4 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Syngap1F6SEU4 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Syngap1F6SEU4 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Syngap1F6SEU4 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Syngap1F6SEU4 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Syngap1F6SEU4 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Syngap1F6SEU4 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Syngap1F6SEU4 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Syngap1F6SEU4 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Syngap1F6SEU4 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Syngap1F6SEU4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Syngap1F6SEU4 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Syngap1F6SEU4 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Syngap1F6SEU4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Syngap1F6SEU4 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Syngap1F6SEU4 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Syngap1F6SEU4 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Syngap1F6SEU4 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Syngap1F6SEU4 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Syngap1F6SEU4 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Syngap1F6SEU4 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Syngap1F6SEU4 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Syngap1F6SEU4 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Syngap1F6SEU4 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Syngap1F6SEU4 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Syngap1F6SEU4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Syngap1F6SEU4 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Syngap1F6SEU4 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Syngap1F6SEU4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Syngap1F6SEU4 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Syngap1F6SEU4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Syngap1F6SEU4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Syngap1F6SEU4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Syngap1F6SEU4 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Syngap1F6SEU4 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Syngap1F6SEU4 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Syngap1F6SEU4 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Syngap1F6SEU4 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Syngap1F6SEU4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Syngap1F6SEU4 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Syngap1F6SEU4 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Syngap1F6SEU4 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Syngap1F6SEU4 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Syngap1F6SEU4 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Syngap1F6SEU4 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Syngap1F6SEU4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Syngap1F6SEU4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Syngap1F6SEU4 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Syngap1F6SEU4 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Syngap1F6SEU4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Syngap1F6SEU4 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Syngap1F6SEU4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Syngap1F6SEU4 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Syngap1F6SEU4 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Syngap1F6SEU4 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Syngap1F6SEU4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Syngap1F6SEU4 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Syngap1F6SEU4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Syngap1F6SEU4 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Syngap1F6SEU4 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Syngap1F6SEU4 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Syngap1F6SEU4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Syngap1F6SEU4 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Syngap1F6SEU4 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Syngap1F6SEU4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Syngap1F6SEU4 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Syngap1F6SEU4 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Syngap1F6SEU4 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Syngap1F6SEU4 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Syngap1F6SEU4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Syngap1F6SEU4 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Syngap1F6SEU4 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Syngap1F6SEU4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Syngap1F6SEU4 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Syngap1F6SEU4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Syngap1F6SEU4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Syngap1F6SEU4 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Syngap1F6SEU4 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Syngap1F6SEU4 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms