Protein–RNA interactions for Protein: E9QAU8

Rnf165, E3 ubiquitin-protein ligase RNF165, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf165E9QAU8 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rnf165E9QAU8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rnf165E9QAU8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rnf165E9QAU8 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rnf165E9QAU8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rnf165E9QAU8 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rnf165E9QAU8 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rnf165E9QAU8 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rnf165E9QAU8 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rnf165E9QAU8 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rnf165E9QAU8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rnf165E9QAU8 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rnf165E9QAU8 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rnf165E9QAU8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rnf165E9QAU8 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rnf165E9QAU8 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rnf165E9QAU8 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rnf165E9QAU8 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Rnf165E9QAU8 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rnf165E9QAU8 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rnf165E9QAU8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rnf165E9QAU8 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rnf165E9QAU8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rnf165E9QAU8 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rnf165E9QAU8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rnf165E9QAU8 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rnf165E9QAU8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rnf165E9QAU8 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
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Rnf165E9QAU8 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Rnf165E9QAU8 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rnf165E9QAU8 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rnf165E9QAU8 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rnf165E9QAU8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rnf165E9QAU8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rnf165E9QAU8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rnf165E9QAU8 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rnf165E9QAU8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rnf165E9QAU8 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rnf165E9QAU8 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rnf165E9QAU8 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rnf165E9QAU8 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rnf165E9QAU8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rnf165E9QAU8 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rnf165E9QAU8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rnf165E9QAU8 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rnf165E9QAU8 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
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Rnf165E9QAU8 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Rnf165E9QAU8 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rnf165E9QAU8 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rnf165E9QAU8 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rnf165E9QAU8 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rnf165E9QAU8 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rnf165E9QAU8 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rnf165E9QAU8 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rnf165E9QAU8 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rnf165E9QAU8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rnf165E9QAU8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rnf165E9QAU8 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rnf165E9QAU8 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
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Rnf165E9QAU8 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
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Rnf165E9QAU8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rnf165E9QAU8 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rnf165E9QAU8 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
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Rnf165E9QAU8 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rnf165E9QAU8 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rnf165E9QAU8 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Rnf165E9QAU8 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rnf165E9QAU8 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rnf165E9QAU8 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rnf165E9QAU8 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rnf165E9QAU8 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rnf165E9QAU8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rnf165E9QAU8 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rnf165E9QAU8 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rnf165E9QAU8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rnf165E9QAU8 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rnf165E9QAU8 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rnf165E9QAU8 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Rnf165E9QAU8 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rnf165E9QAU8 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rnf165E9QAU8 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rnf165E9QAU8 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rnf165E9QAU8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rnf165E9QAU8 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rnf165E9QAU8 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rnf165E9QAU8 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
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