Protein–RNA interactions for Protein: E9QAF4

Phldb3, Pleckstrin homology-like domain, family B, member 3, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phldb3E9QAF4 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Phldb3E9QAF4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Phldb3E9QAF4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Phldb3E9QAF4 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Phldb3E9QAF4 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Phldb3E9QAF4 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Phldb3E9QAF4 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Phldb3E9QAF4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Phldb3E9QAF4 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Phldb3E9QAF4 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Phldb3E9QAF4 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Phldb3E9QAF4 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Phldb3E9QAF4 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Phldb3E9QAF4 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Phldb3E9QAF4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Phldb3E9QAF4 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Phldb3E9QAF4 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Phldb3E9QAF4 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Phldb3E9QAF4 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Phldb3E9QAF4 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Phldb3E9QAF4 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Phldb3E9QAF4 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Phldb3E9QAF4 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Phldb3E9QAF4 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Phldb3E9QAF4 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Phldb3E9QAF4 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Phldb3E9QAF4 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Phldb3E9QAF4 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Phldb3E9QAF4 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Phldb3E9QAF4 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Phldb3E9QAF4 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Phldb3E9QAF4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Phldb3E9QAF4 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Phldb3E9QAF4 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Phldb3E9QAF4 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Phldb3E9QAF4 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Phldb3E9QAF4 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Phldb3E9QAF4 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Phldb3E9QAF4 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Phldb3E9QAF4 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Phldb3E9QAF4 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Phldb3E9QAF4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Phldb3E9QAF4 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Phldb3E9QAF4 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Phldb3E9QAF4 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Phldb3E9QAF4 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Phldb3E9QAF4 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Phldb3E9QAF4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Phldb3E9QAF4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Phldb3E9QAF4 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Phldb3E9QAF4 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Phldb3E9QAF4 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Phldb3E9QAF4 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Phldb3E9QAF4 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Phldb3E9QAF4 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Phldb3E9QAF4 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Phldb3E9QAF4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Phldb3E9QAF4 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Phldb3E9QAF4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Phldb3E9QAF4 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Phldb3E9QAF4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Phldb3E9QAF4 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Phldb3E9QAF4 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Phldb3E9QAF4 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Phldb3E9QAF4 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Phldb3E9QAF4 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Phldb3E9QAF4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Phldb3E9QAF4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Phldb3E9QAF4 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Phldb3E9QAF4 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Phldb3E9QAF4 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Phldb3E9QAF4 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Phldb3E9QAF4 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Phldb3E9QAF4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Phldb3E9QAF4 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Phldb3E9QAF4 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Phldb3E9QAF4 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Phldb3E9QAF4 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Phldb3E9QAF4 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Phldb3E9QAF4 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Phldb3E9QAF4 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Phldb3E9QAF4 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Phldb3E9QAF4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Phldb3E9QAF4 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Phldb3E9QAF4 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Phldb3E9QAF4 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Phldb3E9QAF4 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Phldb3E9QAF4 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Phldb3E9QAF4 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Phldb3E9QAF4 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Phldb3E9QAF4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Phldb3E9QAF4 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Phldb3E9QAF4 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Phldb3E9QAF4 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Phldb3E9QAF4 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Phldb3E9QAF4 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Phldb3E9QAF4 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Phldb3E9QAF4 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Phldb3E9QAF4 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Phldb3E9QAF4 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 157 ms