Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6B2

Ccdc85c, Coiled-coil domain-containing protein 85C, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85cE9Q6B2 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Ccdc85cE9Q6B2 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ccdc85cE9Q6B2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ccdc85cE9Q6B2 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ccdc85cE9Q6B2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ccdc85cE9Q6B2 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ccdc85cE9Q6B2 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ccdc85cE9Q6B2 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ccdc85cE9Q6B2 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ccdc85cE9Q6B2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ccdc85cE9Q6B2 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ccdc85cE9Q6B2 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ccdc85cE9Q6B2 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Ccdc85cE9Q6B2 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Ccdc85cE9Q6B2 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ccdc85cE9Q6B2 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ccdc85cE9Q6B2 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ccdc85cE9Q6B2 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ccdc85cE9Q6B2 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ccdc85cE9Q6B2 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ccdc85cE9Q6B2 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ccdc85cE9Q6B2 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Ccdc85cE9Q6B2 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ccdc85cE9Q6B2 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ccdc85cE9Q6B2 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ccdc85cE9Q6B2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ccdc85cE9Q6B2 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Ccdc85cE9Q6B2 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Ccdc85cE9Q6B2 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ccdc85cE9Q6B2 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ccdc85cE9Q6B2 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ccdc85cE9Q6B2 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ccdc85cE9Q6B2 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ccdc85cE9Q6B2 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ccdc85cE9Q6B2 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ccdc85cE9Q6B2 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Ccdc85cE9Q6B2 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ccdc85cE9Q6B2 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ccdc85cE9Q6B2 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ccdc85cE9Q6B2 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ccdc85cE9Q6B2 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ccdc85cE9Q6B2 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ccdc85cE9Q6B2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ccdc85cE9Q6B2 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ccdc85cE9Q6B2 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ccdc85cE9Q6B2 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Ccdc85cE9Q6B2 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ccdc85cE9Q6B2 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ccdc85cE9Q6B2 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ccdc85cE9Q6B2 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ccdc85cE9Q6B2 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ccdc85cE9Q6B2 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ccdc85cE9Q6B2 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ccdc85cE9Q6B2 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ccdc85cE9Q6B2 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ccdc85cE9Q6B2 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ccdc85cE9Q6B2 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ccdc85cE9Q6B2 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ccdc85cE9Q6B2 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ccdc85cE9Q6B2 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ccdc85cE9Q6B2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ccdc85cE9Q6B2 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ccdc85cE9Q6B2 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ccdc85cE9Q6B2 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ccdc85cE9Q6B2 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ccdc85cE9Q6B2 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ccdc85cE9Q6B2 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ccdc85cE9Q6B2 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ccdc85cE9Q6B2 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Ccdc85cE9Q6B2 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ccdc85cE9Q6B2 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ccdc85cE9Q6B2 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ccdc85cE9Q6B2 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ccdc85cE9Q6B2 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ccdc85cE9Q6B2 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ccdc85cE9Q6B2 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Ccdc85cE9Q6B2 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ccdc85cE9Q6B2 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Ccdc85cE9Q6B2 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ccdc85cE9Q6B2 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Ccdc85cE9Q6B2 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ccdc85cE9Q6B2 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
Ccdc85cE9Q6B2 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ccdc85cE9Q6B2 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ccdc85cE9Q6B2 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ccdc85cE9Q6B2 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ccdc85cE9Q6B2 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ccdc85cE9Q6B2 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ccdc85cE9Q6B2 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ccdc85cE9Q6B2 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ccdc85cE9Q6B2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ccdc85cE9Q6B2 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ccdc85cE9Q6B2 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ccdc85cE9Q6B2 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ccdc85cE9Q6B2 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ccdc85cE9Q6B2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ccdc85cE9Q6B2 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ccdc85cE9Q6B2 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ccdc85cE9Q6B2 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ccdc85cE9Q6B2 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 162.1 ms