Protein–RNA interactions for Protein: E9Q492

Pgbd1, PiggyBac transposable element-derived 1, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgbd1E9Q492 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pgbd1E9Q492 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pgbd1E9Q492 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pgbd1E9Q492 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pgbd1E9Q492 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pgbd1E9Q492 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pgbd1E9Q492 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pgbd1E9Q492 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pgbd1E9Q492 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pgbd1E9Q492 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pgbd1E9Q492 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pgbd1E9Q492 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pgbd1E9Q492 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pgbd1E9Q492 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pgbd1E9Q492 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pgbd1E9Q492 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pgbd1E9Q492 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pgbd1E9Q492 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pgbd1E9Q492 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pgbd1E9Q492 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pgbd1E9Q492 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pgbd1E9Q492 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pgbd1E9Q492 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pgbd1E9Q492 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pgbd1E9Q492 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pgbd1E9Q492 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pgbd1E9Q492 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pgbd1E9Q492 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pgbd1E9Q492 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pgbd1E9Q492 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pgbd1E9Q492 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pgbd1E9Q492 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pgbd1E9Q492 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Pgbd1E9Q492 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pgbd1E9Q492 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pgbd1E9Q492 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pgbd1E9Q492 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pgbd1E9Q492 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pgbd1E9Q492 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pgbd1E9Q492 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pgbd1E9Q492 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pgbd1E9Q492 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pgbd1E9Q492 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pgbd1E9Q492 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pgbd1E9Q492 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pgbd1E9Q492 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pgbd1E9Q492 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pgbd1E9Q492 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pgbd1E9Q492 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pgbd1E9Q492 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pgbd1E9Q492 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pgbd1E9Q492 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pgbd1E9Q492 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pgbd1E9Q492 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pgbd1E9Q492 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pgbd1E9Q492 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pgbd1E9Q492 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pgbd1E9Q492 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pgbd1E9Q492 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pgbd1E9Q492 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Pgbd1E9Q492 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Pgbd1E9Q492 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pgbd1E9Q492 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pgbd1E9Q492 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pgbd1E9Q492 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Pgbd1E9Q492 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pgbd1E9Q492 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pgbd1E9Q492 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pgbd1E9Q492 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pgbd1E9Q492 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pgbd1E9Q492 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pgbd1E9Q492 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pgbd1E9Q492 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pgbd1E9Q492 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pgbd1E9Q492 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pgbd1E9Q492 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pgbd1E9Q492 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pgbd1E9Q492 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pgbd1E9Q492 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pgbd1E9Q492 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pgbd1E9Q492 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pgbd1E9Q492 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pgbd1E9Q492 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pgbd1E9Q492 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pgbd1E9Q492 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pgbd1E9Q492 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pgbd1E9Q492 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pgbd1E9Q492 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pgbd1E9Q492 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pgbd1E9Q492 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pgbd1E9Q492 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pgbd1E9Q492 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pgbd1E9Q492 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pgbd1E9Q492 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pgbd1E9Q492 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Pgbd1E9Q492 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pgbd1E9Q492 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pgbd1E9Q492 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pgbd1E9Q492 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pgbd1E9Q492 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms