Protein–RNA interactions for Protein: E9PYQ0

Rsph10b, Radial spoke head 10 homolog B (Chlamydomonas), mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph10bE9PYQ0 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rsph10bE9PYQ0 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rsph10bE9PYQ0 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rsph10bE9PYQ0 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rsph10bE9PYQ0 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rsph10bE9PYQ0 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rsph10bE9PYQ0 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rsph10bE9PYQ0 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rsph10bE9PYQ0 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rsph10bE9PYQ0 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rsph10bE9PYQ0 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rsph10bE9PYQ0 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rsph10bE9PYQ0 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rsph10bE9PYQ0 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rsph10bE9PYQ0 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rsph10bE9PYQ0 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rsph10bE9PYQ0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rsph10bE9PYQ0 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rsph10bE9PYQ0 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rsph10bE9PYQ0 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rsph10bE9PYQ0 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rsph10bE9PYQ0 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rsph10bE9PYQ0 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rsph10bE9PYQ0 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rsph10bE9PYQ0 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rsph10bE9PYQ0 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Rsph10bE9PYQ0 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Rsph10bE9PYQ0 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Rsph10bE9PYQ0 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rsph10bE9PYQ0 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rsph10bE9PYQ0 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rsph10bE9PYQ0 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rsph10bE9PYQ0 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rsph10bE9PYQ0 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rsph10bE9PYQ0 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Rsph10bE9PYQ0 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rsph10bE9PYQ0 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rsph10bE9PYQ0 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rsph10bE9PYQ0 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rsph10bE9PYQ0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rsph10bE9PYQ0 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rsph10bE9PYQ0 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Rsph10bE9PYQ0 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rsph10bE9PYQ0 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rsph10bE9PYQ0 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rsph10bE9PYQ0 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rsph10bE9PYQ0 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rsph10bE9PYQ0 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rsph10bE9PYQ0 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rsph10bE9PYQ0 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rsph10bE9PYQ0 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rsph10bE9PYQ0 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rsph10bE9PYQ0 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rsph10bE9PYQ0 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Rsph10bE9PYQ0 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rsph10bE9PYQ0 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rsph10bE9PYQ0 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rsph10bE9PYQ0 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rsph10bE9PYQ0 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rsph10bE9PYQ0 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rsph10bE9PYQ0 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Rsph10bE9PYQ0 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rsph10bE9PYQ0 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rsph10bE9PYQ0 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rsph10bE9PYQ0 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rsph10bE9PYQ0 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rsph10bE9PYQ0 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rsph10bE9PYQ0 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rsph10bE9PYQ0 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rsph10bE9PYQ0 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rsph10bE9PYQ0 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rsph10bE9PYQ0 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rsph10bE9PYQ0 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rsph10bE9PYQ0 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rsph10bE9PYQ0 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rsph10bE9PYQ0 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rsph10bE9PYQ0 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rsph10bE9PYQ0 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rsph10bE9PYQ0 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rsph10bE9PYQ0 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rsph10bE9PYQ0 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rsph10bE9PYQ0 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rsph10bE9PYQ0 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rsph10bE9PYQ0 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rsph10bE9PYQ0 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rsph10bE9PYQ0 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rsph10bE9PYQ0 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rsph10bE9PYQ0 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rsph10bE9PYQ0 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rsph10bE9PYQ0 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Rsph10bE9PYQ0 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rsph10bE9PYQ0 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rsph10bE9PYQ0 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rsph10bE9PYQ0 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rsph10bE9PYQ0 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rsph10bE9PYQ0 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rsph10bE9PYQ0 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rsph10bE9PYQ0 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rsph10bE9PYQ0 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rsph10bE9PYQ0 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms