Protein–RNA interactions for Protein: B2RX70

Cped1, Cadherin-like and PC-esterase domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cped1B2RX70 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cped1B2RX70 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cped1B2RX70 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cped1B2RX70 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cped1B2RX70 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cped1B2RX70 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cped1B2RX70 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cped1B2RX70 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cped1B2RX70 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cped1B2RX70 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cped1B2RX70 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cped1B2RX70 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cped1B2RX70 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cped1B2RX70 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cped1B2RX70 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cped1B2RX70 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Cped1B2RX70 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Cped1B2RX70 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cped1B2RX70 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cped1B2RX70 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cped1B2RX70 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cped1B2RX70 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Cped1B2RX70 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.31■■□□□ 1
Cped1B2RX70 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cped1B2RX70 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cped1B2RX70 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cped1B2RX70 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cped1B2RX70 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cped1B2RX70 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cped1B2RX70 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cped1B2RX70 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cped1B2RX70 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cped1B2RX70 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cped1B2RX70 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Cped1B2RX70 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cped1B2RX70 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cped1B2RX70 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Cped1B2RX70 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cped1B2RX70 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cped1B2RX70 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Cped1B2RX70 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Cped1B2RX70 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cped1B2RX70 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cped1B2RX70 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cped1B2RX70 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cped1B2RX70 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cped1B2RX70 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cped1B2RX70 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cped1B2RX70 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cped1B2RX70 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cped1B2RX70 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cped1B2RX70 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cped1B2RX70 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cped1B2RX70 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cped1B2RX70 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cped1B2RX70 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cped1B2RX70 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cped1B2RX70 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cped1B2RX70 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cped1B2RX70 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cped1B2RX70 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cped1B2RX70 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Cped1B2RX70 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cped1B2RX70 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cped1B2RX70 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cped1B2RX70 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cped1B2RX70 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cped1B2RX70 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cped1B2RX70 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cped1B2RX70 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cped1B2RX70 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cped1B2RX70 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cped1B2RX70 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cped1B2RX70 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cped1B2RX70 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cped1B2RX70 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cped1B2RX70 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cped1B2RX70 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cped1B2RX70 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cped1B2RX70 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cped1B2RX70 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cped1B2RX70 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cped1B2RX70 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cped1B2RX70 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cped1B2RX70 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cped1B2RX70 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cped1B2RX70 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cped1B2RX70 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cped1B2RX70 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cped1B2RX70 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cped1B2RX70 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cped1B2RX70 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cped1B2RX70 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cped1B2RX70 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cped1B2RX70 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Cped1B2RX70 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Cped1B2RX70 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Cped1B2RX70 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cped1B2RX70 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Cped1B2RX70 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 132.7 ms