Protein–RNA interactions for Protein: B2RW27

1700018F24Rik, 1700018F24Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700018F24RikB2RW27 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
1700018F24RikB2RW27 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
1700018F24RikB2RW27 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
1700018F24RikB2RW27 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
1700018F24RikB2RW27 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
1700018F24RikB2RW27 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
1700018F24RikB2RW27 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
1700018F24RikB2RW27 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
1700018F24RikB2RW27 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
1700018F24RikB2RW27 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
1700018F24RikB2RW27 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
1700018F24RikB2RW27 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
1700018F24RikB2RW27 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
1700018F24RikB2RW27 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
1700018F24RikB2RW27 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
1700018F24RikB2RW27 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
1700018F24RikB2RW27 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
1700018F24RikB2RW27 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
1700018F24RikB2RW27 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
1700018F24RikB2RW27 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
1700018F24RikB2RW27 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
1700018F24RikB2RW27 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
1700018F24RikB2RW27 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
1700018F24RikB2RW27 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
1700018F24RikB2RW27 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
1700018F24RikB2RW27 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
1700018F24RikB2RW27 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
1700018F24RikB2RW27 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
1700018F24RikB2RW27 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
1700018F24RikB2RW27 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
1700018F24RikB2RW27 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
1700018F24RikB2RW27 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
1700018F24RikB2RW27 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
1700018F24RikB2RW27 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
1700018F24RikB2RW27 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
1700018F24RikB2RW27 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
1700018F24RikB2RW27 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
1700018F24RikB2RW27 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
1700018F24RikB2RW27 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
1700018F24RikB2RW27 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
1700018F24RikB2RW27 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
1700018F24RikB2RW27 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
1700018F24RikB2RW27 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
1700018F24RikB2RW27 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
1700018F24RikB2RW27 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
1700018F24RikB2RW27 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
1700018F24RikB2RW27 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
1700018F24RikB2RW27 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
1700018F24RikB2RW27 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
1700018F24RikB2RW27 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
1700018F24RikB2RW27 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
1700018F24RikB2RW27 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
1700018F24RikB2RW27 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
1700018F24RikB2RW27 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
1700018F24RikB2RW27 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
1700018F24RikB2RW27 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
1700018F24RikB2RW27 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
1700018F24RikB2RW27 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
1700018F24RikB2RW27 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
1700018F24RikB2RW27 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
1700018F24RikB2RW27 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
1700018F24RikB2RW27 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
1700018F24RikB2RW27 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
1700018F24RikB2RW27 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
1700018F24RikB2RW27 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
1700018F24RikB2RW27 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
1700018F24RikB2RW27 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
1700018F24RikB2RW27 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
1700018F24RikB2RW27 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
1700018F24RikB2RW27 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
1700018F24RikB2RW27 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
1700018F24RikB2RW27 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
1700018F24RikB2RW27 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
1700018F24RikB2RW27 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
1700018F24RikB2RW27 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
1700018F24RikB2RW27 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
1700018F24RikB2RW27 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
1700018F24RikB2RW27 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
1700018F24RikB2RW27 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
1700018F24RikB2RW27 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
1700018F24RikB2RW27 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
1700018F24RikB2RW27 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
1700018F24RikB2RW27 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
1700018F24RikB2RW27 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
1700018F24RikB2RW27 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
1700018F24RikB2RW27 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
1700018F24RikB2RW27 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
1700018F24RikB2RW27 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
1700018F24RikB2RW27 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
1700018F24RikB2RW27 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
1700018F24RikB2RW27 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
1700018F24RikB2RW27 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
1700018F24RikB2RW27 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
1700018F24RikB2RW27 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
1700018F24RikB2RW27 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
1700018F24RikB2RW27 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
1700018F24RikB2RW27 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
1700018F24RikB2RW27 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
1700018F24RikB2RW27 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
1700018F24RikB2RW27 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 135.6 ms