Protein–RNA interactions for Protein: B2KGE5

Fam229a, Protein FAM229A, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam229aB2KGE5 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Fam229aB2KGE5 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Fam229aB2KGE5 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Fam229aB2KGE5 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Fam229aB2KGE5 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Fam229aB2KGE5 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Fam229aB2KGE5 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Fam229aB2KGE5 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Fam229aB2KGE5 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Fam229aB2KGE5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Fam229aB2KGE5 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Fam229aB2KGE5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Fam229aB2KGE5 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Fam229aB2KGE5 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Fam229aB2KGE5 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Fam229aB2KGE5 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Fam229aB2KGE5 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Fam229aB2KGE5 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Fam229aB2KGE5 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Fam229aB2KGE5 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Fam229aB2KGE5 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Fam229aB2KGE5 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fam229aB2KGE5 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fam229aB2KGE5 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fam229aB2KGE5 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fam229aB2KGE5 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Fam229aB2KGE5 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fam229aB2KGE5 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fam229aB2KGE5 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fam229aB2KGE5 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fam229aB2KGE5 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fam229aB2KGE5 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fam229aB2KGE5 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fam229aB2KGE5 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fam229aB2KGE5 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fam229aB2KGE5 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fam229aB2KGE5 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fam229aB2KGE5 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fam229aB2KGE5 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fam229aB2KGE5 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fam229aB2KGE5 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fam229aB2KGE5 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Fam229aB2KGE5 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Fam229aB2KGE5 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Fam229aB2KGE5 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Fam229aB2KGE5 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Fam229aB2KGE5 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Fam229aB2KGE5 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Fam229aB2KGE5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Fam229aB2KGE5 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Fam229aB2KGE5 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Fam229aB2KGE5 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Fam229aB2KGE5 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Fam229aB2KGE5 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fam229aB2KGE5 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fam229aB2KGE5 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fam229aB2KGE5 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fam229aB2KGE5 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fam229aB2KGE5 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fam229aB2KGE5 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fam229aB2KGE5 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fam229aB2KGE5 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fam229aB2KGE5 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fam229aB2KGE5 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fam229aB2KGE5 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fam229aB2KGE5 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fam229aB2KGE5 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fam229aB2KGE5 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fam229aB2KGE5 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fam229aB2KGE5 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fam229aB2KGE5 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fam229aB2KGE5 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fam229aB2KGE5 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fam229aB2KGE5 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fam229aB2KGE5 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fam229aB2KGE5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fam229aB2KGE5 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fam229aB2KGE5 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fam229aB2KGE5 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fam229aB2KGE5 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fam229aB2KGE5 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fam229aB2KGE5 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fam229aB2KGE5 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Fam229aB2KGE5 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Fam229aB2KGE5 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Fam229aB2KGE5 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Fam229aB2KGE5 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Fam229aB2KGE5 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Fam229aB2KGE5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Fam229aB2KGE5 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Fam229aB2KGE5 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Fam229aB2KGE5 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Fam229aB2KGE5 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Fam229aB2KGE5 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Fam229aB2KGE5 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Fam229aB2KGE5 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Fam229aB2KGE5 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Fam229aB2KGE5 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Fam229aB2KGE5 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Fam229aB2KGE5 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms