Protein–RNA interactions for Protein: B1AUF7

1700042G07Rik, MCG1049117, mousemouse

Predictions only

Length 90 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700042G07RikB1AUF7 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
1700042G07RikB1AUF7 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
1700042G07RikB1AUF7 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
1700042G07RikB1AUF7 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
1700042G07RikB1AUF7 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
1700042G07RikB1AUF7 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
1700042G07RikB1AUF7 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
1700042G07RikB1AUF7 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
1700042G07RikB1AUF7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
1700042G07RikB1AUF7 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
1700042G07RikB1AUF7 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
1700042G07RikB1AUF7 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
1700042G07RikB1AUF7 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
1700042G07RikB1AUF7 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
1700042G07RikB1AUF7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
1700042G07RikB1AUF7 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
1700042G07RikB1AUF7 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
1700042G07RikB1AUF7 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
1700042G07RikB1AUF7 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
1700042G07RikB1AUF7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
1700042G07RikB1AUF7 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
1700042G07RikB1AUF7 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
1700042G07RikB1AUF7 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
1700042G07RikB1AUF7 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
1700042G07RikB1AUF7 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
1700042G07RikB1AUF7 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
1700042G07RikB1AUF7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
1700042G07RikB1AUF7 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
1700042G07RikB1AUF7 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
1700042G07RikB1AUF7 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
1700042G07RikB1AUF7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
1700042G07RikB1AUF7 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
1700042G07RikB1AUF7 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
1700042G07RikB1AUF7 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
1700042G07RikB1AUF7 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
1700042G07RikB1AUF7 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
1700042G07RikB1AUF7 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
1700042G07RikB1AUF7 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
1700042G07RikB1AUF7 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
1700042G07RikB1AUF7 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
1700042G07RikB1AUF7 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
1700042G07RikB1AUF7 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
1700042G07RikB1AUF7 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
1700042G07RikB1AUF7 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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1700042G07RikB1AUF7 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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1700042G07RikB1AUF7 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
1700042G07RikB1AUF7 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
1700042G07RikB1AUF7 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
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1700042G07RikB1AUF7 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
1700042G07RikB1AUF7 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
1700042G07RikB1AUF7 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
1700042G07RikB1AUF7 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
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1700042G07RikB1AUF7 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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1700042G07RikB1AUF7 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
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1700042G07RikB1AUF7 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
1700042G07RikB1AUF7 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
1700042G07RikB1AUF7 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
1700042G07RikB1AUF7 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
1700042G07RikB1AUF7 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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1700042G07RikB1AUF7 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
1700042G07RikB1AUF7 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
1700042G07RikB1AUF7 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
1700042G07RikB1AUF7 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
1700042G07RikB1AUF7 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
1700042G07RikB1AUF7 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
1700042G07RikB1AUF7 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
1700042G07RikB1AUF7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
1700042G07RikB1AUF7 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
1700042G07RikB1AUF7 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
1700042G07RikB1AUF7 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
1700042G07RikB1AUF7 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
1700042G07RikB1AUF7 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
1700042G07RikB1AUF7 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
1700042G07RikB1AUF7 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
1700042G07RikB1AUF7 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
1700042G07RikB1AUF7 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
1700042G07RikB1AUF7 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
1700042G07RikB1AUF7 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
1700042G07RikB1AUF7 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
1700042G07RikB1AUF7 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
1700042G07RikB1AUF7 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
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1700042G07RikB1AUF7 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
1700042G07RikB1AUF7 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
1700042G07RikB1AUF7 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
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1700042G07RikB1AUF7 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
1700042G07RikB1AUF7 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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