Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Spocd1B1ASB6 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Spocd1B1ASB6 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Spocd1B1ASB6 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Spocd1B1ASB6 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Spocd1B1ASB6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Spocd1B1ASB6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Spocd1B1ASB6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Spocd1B1ASB6 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Spocd1B1ASB6 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Spocd1B1ASB6 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Spocd1B1ASB6 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Spocd1B1ASB6 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Spocd1B1ASB6 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Spocd1B1ASB6 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Spocd1B1ASB6 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Spocd1B1ASB6 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Spocd1B1ASB6 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Spocd1B1ASB6 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Spocd1B1ASB6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Spocd1B1ASB6 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Spocd1B1ASB6 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Spocd1B1ASB6 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Spocd1B1ASB6 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Spocd1B1ASB6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Spocd1B1ASB6 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Spocd1B1ASB6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Spocd1B1ASB6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Spocd1B1ASB6 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Spocd1B1ASB6 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Spocd1B1ASB6 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Spocd1B1ASB6 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Spocd1B1ASB6 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Spocd1B1ASB6 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Spocd1B1ASB6 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Spocd1B1ASB6 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Spocd1B1ASB6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Spocd1B1ASB6 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Spocd1B1ASB6 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Spocd1B1ASB6 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Spocd1B1ASB6 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Spocd1B1ASB6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Spocd1B1ASB6 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Spocd1B1ASB6 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Spocd1B1ASB6 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Spocd1B1ASB6 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Spocd1B1ASB6 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Spocd1B1ASB6 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Spocd1B1ASB6 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Spocd1B1ASB6 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Spocd1B1ASB6 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Spocd1B1ASB6 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Spocd1B1ASB6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Spocd1B1ASB6 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Spocd1B1ASB6 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Spocd1B1ASB6 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Spocd1B1ASB6 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Spocd1B1ASB6 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Spocd1B1ASB6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Spocd1B1ASB6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Spocd1B1ASB6 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Spocd1B1ASB6 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Spocd1B1ASB6 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Spocd1B1ASB6 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Spocd1B1ASB6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Spocd1B1ASB6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Spocd1B1ASB6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Spocd1B1ASB6 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Spocd1B1ASB6 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Spocd1B1ASB6 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Spocd1B1ASB6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Spocd1B1ASB6 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Spocd1B1ASB6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Spocd1B1ASB6 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Spocd1B1ASB6 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Spocd1B1ASB6 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Spocd1B1ASB6 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Spocd1B1ASB6 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Spocd1B1ASB6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Spocd1B1ASB6 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Spocd1B1ASB6 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Spocd1B1ASB6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Spocd1B1ASB6 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Spocd1B1ASB6 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Spocd1B1ASB6 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Spocd1B1ASB6 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Spocd1B1ASB6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Spocd1B1ASB6 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Spocd1B1ASB6 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Spocd1B1ASB6 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Spocd1B1ASB6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Spocd1B1ASB6 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Spocd1B1ASB6 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Spocd1B1ASB6 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Spocd1B1ASB6 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Spocd1B1ASB6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Spocd1B1ASB6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Spocd1B1ASB6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Spocd1B1ASB6 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Spocd1B1ASB6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms