Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB3

Gm438, MCG65768, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm438B1ASB3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gm438B1ASB3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gm438B1ASB3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gm438B1ASB3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gm438B1ASB3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gm438B1ASB3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gm438B1ASB3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gm438B1ASB3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gm438B1ASB3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gm438B1ASB3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Gm438B1ASB3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gm438B1ASB3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gm438B1ASB3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gm438B1ASB3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gm438B1ASB3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gm438B1ASB3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gm438B1ASB3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gm438B1ASB3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gm438B1ASB3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gm438B1ASB3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gm438B1ASB3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gm438B1ASB3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gm438B1ASB3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gm438B1ASB3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gm438B1ASB3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gm438B1ASB3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gm438B1ASB3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Gm438B1ASB3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gm438B1ASB3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gm438B1ASB3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gm438B1ASB3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gm438B1ASB3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gm438B1ASB3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gm438B1ASB3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gm438B1ASB3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gm438B1ASB3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gm438B1ASB3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gm438B1ASB3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gm438B1ASB3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gm438B1ASB3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gm438B1ASB3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gm438B1ASB3 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gm438B1ASB3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gm438B1ASB3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Gm438B1ASB3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gm438B1ASB3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gm438B1ASB3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gm438B1ASB3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Gm438B1ASB3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm438B1ASB3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm438B1ASB3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm438B1ASB3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm438B1ASB3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm438B1ASB3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gm438B1ASB3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gm438B1ASB3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gm438B1ASB3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gm438B1ASB3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gm438B1ASB3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gm438B1ASB3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gm438B1ASB3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm438B1ASB3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm438B1ASB3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm438B1ASB3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm438B1ASB3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm438B1ASB3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm438B1ASB3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm438B1ASB3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm438B1ASB3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm438B1ASB3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm438B1ASB3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm438B1ASB3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm438B1ASB3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm438B1ASB3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm438B1ASB3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm438B1ASB3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm438B1ASB3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm438B1ASB3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm438B1ASB3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm438B1ASB3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm438B1ASB3 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm438B1ASB3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm438B1ASB3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm438B1ASB3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm438B1ASB3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm438B1ASB3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm438B1ASB3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm438B1ASB3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm438B1ASB3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm438B1ASB3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm438B1ASB3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm438B1ASB3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm438B1ASB3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm438B1ASB3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm438B1ASB3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm438B1ASB3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm438B1ASB3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm438B1ASB3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm438B1ASB3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm438B1ASB3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.2 ms