Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
H2-M5A7VMS3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
H2-M5A7VMS3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
H2-M5A7VMS3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
H2-M5A7VMS3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
H2-M5A7VMS3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
H2-M5A7VMS3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
H2-M5A7VMS3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
H2-M5A7VMS3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
H2-M5A7VMS3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
H2-M5A7VMS3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
H2-M5A7VMS3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
H2-M5A7VMS3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
H2-M5A7VMS3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
H2-M5A7VMS3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
H2-M5A7VMS3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
H2-M5A7VMS3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
H2-M5A7VMS3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
H2-M5A7VMS3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
H2-M5A7VMS3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
H2-M5A7VMS3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
H2-M5A7VMS3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
H2-M5A7VMS3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
H2-M5A7VMS3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
H2-M5A7VMS3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
H2-M5A7VMS3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
H2-M5A7VMS3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
H2-M5A7VMS3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
H2-M5A7VMS3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
H2-M5A7VMS3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
H2-M5A7VMS3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
H2-M5A7VMS3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
H2-M5A7VMS3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
H2-M5A7VMS3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
H2-M5A7VMS3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
H2-M5A7VMS3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
H2-M5A7VMS3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
H2-M5A7VMS3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
H2-M5A7VMS3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
H2-M5A7VMS3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
H2-M5A7VMS3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
H2-M5A7VMS3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
H2-M5A7VMS3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
H2-M5A7VMS3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
H2-M5A7VMS3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
H2-M5A7VMS3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
H2-M5A7VMS3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
H2-M5A7VMS3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
H2-M5A7VMS3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
H2-M5A7VMS3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
H2-M5A7VMS3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
H2-M5A7VMS3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
H2-M5A7VMS3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
H2-M5A7VMS3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
H2-M5A7VMS3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
H2-M5A7VMS3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
H2-M5A7VMS3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
H2-M5A7VMS3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
H2-M5A7VMS3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
H2-M5A7VMS3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
H2-M5A7VMS3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
H2-M5A7VMS3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2-M5A7VMS3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2-M5A7VMS3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2-M5A7VMS3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2-M5A7VMS3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2-M5A7VMS3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2-M5A7VMS3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2-M5A7VMS3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2-M5A7VMS3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2-M5A7VMS3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2-M5A7VMS3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2-M5A7VMS3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2-M5A7VMS3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2-M5A7VMS3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2-M5A7VMS3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2-M5A7VMS3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2-M5A7VMS3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2-M5A7VMS3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2-M5A7VMS3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2-M5A7VMS3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2-M5A7VMS3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2-M5A7VMS3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2-M5A7VMS3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
H2-M5A7VMS3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2-M5A7VMS3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2-M5A7VMS3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2-M5A7VMS3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2-M5A7VMS3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
H2-M5A7VMS3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2-M5A7VMS3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2-M5A7VMS3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2-M5A7VMS3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2-M5A7VMS3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2-M5A7VMS3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2-M5A7VMS3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2-M5A7VMS3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
H2-M5A7VMS3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
H2-M5A7VMS3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2-M5A7VMS3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
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