Protein–RNA interactions for Protein: A6X8Z9

4930435E12Rik, RIKEN cDNA 4930435E12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930435E12RikA6X8Z9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
4930435E12RikA6X8Z9 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
4930435E12RikA6X8Z9 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
4930435E12RikA6X8Z9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
4930435E12RikA6X8Z9 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
4930435E12RikA6X8Z9 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
4930435E12RikA6X8Z9 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
4930435E12RikA6X8Z9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
4930435E12RikA6X8Z9 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
4930435E12RikA6X8Z9 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
4930435E12RikA6X8Z9 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
4930435E12RikA6X8Z9 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
4930435E12RikA6X8Z9 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
4930435E12RikA6X8Z9 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
4930435E12RikA6X8Z9 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
4930435E12RikA6X8Z9 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
4930435E12RikA6X8Z9 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
4930435E12RikA6X8Z9 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
4930435E12RikA6X8Z9 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
4930435E12RikA6X8Z9 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
4930435E12RikA6X8Z9 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
4930435E12RikA6X8Z9 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
4930435E12RikA6X8Z9 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
4930435E12RikA6X8Z9 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
4930435E12RikA6X8Z9 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
4930435E12RikA6X8Z9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
4930435E12RikA6X8Z9 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
4930435E12RikA6X8Z9 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
4930435E12RikA6X8Z9 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
4930435E12RikA6X8Z9 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
4930435E12RikA6X8Z9 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
4930435E12RikA6X8Z9 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
4930435E12RikA6X8Z9 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
4930435E12RikA6X8Z9 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
4930435E12RikA6X8Z9 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
4930435E12RikA6X8Z9 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
4930435E12RikA6X8Z9 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
4930435E12RikA6X8Z9 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
4930435E12RikA6X8Z9 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
4930435E12RikA6X8Z9 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
4930435E12RikA6X8Z9 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
4930435E12RikA6X8Z9 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
4930435E12RikA6X8Z9 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
4930435E12RikA6X8Z9 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
4930435E12RikA6X8Z9 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
4930435E12RikA6X8Z9 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
4930435E12RikA6X8Z9 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
4930435E12RikA6X8Z9 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
4930435E12RikA6X8Z9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
4930435E12RikA6X8Z9 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
4930435E12RikA6X8Z9 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
4930435E12RikA6X8Z9 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
4930435E12RikA6X8Z9 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
4930435E12RikA6X8Z9 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
4930435E12RikA6X8Z9 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
4930435E12RikA6X8Z9 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
4930435E12RikA6X8Z9 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
4930435E12RikA6X8Z9 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
4930435E12RikA6X8Z9 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
4930435E12RikA6X8Z9 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
4930435E12RikA6X8Z9 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
4930435E12RikA6X8Z9 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
4930435E12RikA6X8Z9 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
4930435E12RikA6X8Z9 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
4930435E12RikA6X8Z9 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
4930435E12RikA6X8Z9 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
4930435E12RikA6X8Z9 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
4930435E12RikA6X8Z9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
4930435E12RikA6X8Z9 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
4930435E12RikA6X8Z9 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
4930435E12RikA6X8Z9 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
4930435E12RikA6X8Z9 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
4930435E12RikA6X8Z9 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
4930435E12RikA6X8Z9 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
4930435E12RikA6X8Z9 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
4930435E12RikA6X8Z9 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
4930435E12RikA6X8Z9 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
4930435E12RikA6X8Z9 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
4930435E12RikA6X8Z9 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
4930435E12RikA6X8Z9 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
4930435E12RikA6X8Z9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
4930435E12RikA6X8Z9 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
4930435E12RikA6X8Z9 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
4930435E12RikA6X8Z9 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
4930435E12RikA6X8Z9 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
4930435E12RikA6X8Z9 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
4930435E12RikA6X8Z9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
4930435E12RikA6X8Z9 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
4930435E12RikA6X8Z9 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
4930435E12RikA6X8Z9 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
4930435E12RikA6X8Z9 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
4930435E12RikA6X8Z9 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
4930435E12RikA6X8Z9 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
4930435E12RikA6X8Z9 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
4930435E12RikA6X8Z9 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
4930435E12RikA6X8Z9 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
4930435E12RikA6X8Z9 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
4930435E12RikA6X8Z9 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
4930435E12RikA6X8Z9 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
4930435E12RikA6X8Z9 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms