Protein–RNA interactions for Protein: A4Q9E5

Ttll3, Tubulin monoglycylase TTLL3, mousemouse

Predictions only

Length 927 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll3A4Q9E5 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ttll3A4Q9E5 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ttll3A4Q9E5 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ttll3A4Q9E5 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ttll3A4Q9E5 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ttll3A4Q9E5 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ttll3A4Q9E5 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Ttll3A4Q9E5 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ttll3A4Q9E5 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ttll3A4Q9E5 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ttll3A4Q9E5 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ttll3A4Q9E5 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ttll3A4Q9E5 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ttll3A4Q9E5 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ttll3A4Q9E5 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ttll3A4Q9E5 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ttll3A4Q9E5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ttll3A4Q9E5 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ttll3A4Q9E5 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ttll3A4Q9E5 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ttll3A4Q9E5 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ttll3A4Q9E5 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ttll3A4Q9E5 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ttll3A4Q9E5 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ttll3A4Q9E5 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ttll3A4Q9E5 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ttll3A4Q9E5 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ttll3A4Q9E5 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ttll3A4Q9E5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ttll3A4Q9E5 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ttll3A4Q9E5 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ttll3A4Q9E5 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ttll3A4Q9E5 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ttll3A4Q9E5 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ttll3A4Q9E5 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ttll3A4Q9E5 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ttll3A4Q9E5 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ttll3A4Q9E5 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ttll3A4Q9E5 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ttll3A4Q9E5 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ttll3A4Q9E5 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ttll3A4Q9E5 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ttll3A4Q9E5 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ttll3A4Q9E5 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ttll3A4Q9E5 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ttll3A4Q9E5 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ttll3A4Q9E5 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ttll3A4Q9E5 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ttll3A4Q9E5 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ttll3A4Q9E5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ttll3A4Q9E5 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ttll3A4Q9E5 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ttll3A4Q9E5 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ttll3A4Q9E5 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ttll3A4Q9E5 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ttll3A4Q9E5 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ttll3A4Q9E5 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ttll3A4Q9E5 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ttll3A4Q9E5 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ttll3A4Q9E5 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ttll3A4Q9E5 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ttll3A4Q9E5 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ttll3A4Q9E5 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ttll3A4Q9E5 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ttll3A4Q9E5 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ttll3A4Q9E5 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ttll3A4Q9E5 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ttll3A4Q9E5 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ttll3A4Q9E5 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ttll3A4Q9E5 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ttll3A4Q9E5 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ttll3A4Q9E5 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ttll3A4Q9E5 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ttll3A4Q9E5 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ttll3A4Q9E5 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ttll3A4Q9E5 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ttll3A4Q9E5 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ttll3A4Q9E5 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ttll3A4Q9E5 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ttll3A4Q9E5 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ttll3A4Q9E5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ttll3A4Q9E5 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ttll3A4Q9E5 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ttll3A4Q9E5 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ttll3A4Q9E5 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ttll3A4Q9E5 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ttll3A4Q9E5 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ttll3A4Q9E5 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ttll3A4Q9E5 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ttll3A4Q9E5 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ttll3A4Q9E5 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ttll3A4Q9E5 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ttll3A4Q9E5 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ttll3A4Q9E5 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ttll3A4Q9E5 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ttll3A4Q9E5 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ttll3A4Q9E5 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ttll3A4Q9E5 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Ttll3A4Q9E5 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ttll3A4Q9E5 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.9 ms