Protein–RNA interactions for Protein: A2RTT5

Vmn1r232, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r232A2RTT5 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vmn1r232A2RTT5 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vmn1r232A2RTT5 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vmn1r232A2RTT5 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vmn1r232A2RTT5 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vmn1r232A2RTT5 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vmn1r232A2RTT5 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vmn1r232A2RTT5 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vmn1r232A2RTT5 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vmn1r232A2RTT5 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vmn1r232A2RTT5 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vmn1r232A2RTT5 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vmn1r232A2RTT5 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vmn1r232A2RTT5 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vmn1r232A2RTT5 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vmn1r232A2RTT5 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vmn1r232A2RTT5 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vmn1r232A2RTT5 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Vmn1r232A2RTT5 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vmn1r232A2RTT5 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vmn1r232A2RTT5 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vmn1r232A2RTT5 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vmn1r232A2RTT5 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vmn1r232A2RTT5 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vmn1r232A2RTT5 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vmn1r232A2RTT5 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vmn1r232A2RTT5 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vmn1r232A2RTT5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vmn1r232A2RTT5 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vmn1r232A2RTT5 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vmn1r232A2RTT5 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vmn1r232A2RTT5 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vmn1r232A2RTT5 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vmn1r232A2RTT5 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Vmn1r232A2RTT5 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Vmn1r232A2RTT5 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Vmn1r232A2RTT5 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vmn1r232A2RTT5 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vmn1r232A2RTT5 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vmn1r232A2RTT5 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vmn1r232A2RTT5 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vmn1r232A2RTT5 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vmn1r232A2RTT5 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vmn1r232A2RTT5 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Vmn1r232A2RTT5 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vmn1r232A2RTT5 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vmn1r232A2RTT5 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vmn1r232A2RTT5 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vmn1r232A2RTT5 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vmn1r232A2RTT5 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Vmn1r232A2RTT5 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vmn1r232A2RTT5 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vmn1r232A2RTT5 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vmn1r232A2RTT5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vmn1r232A2RTT5 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vmn1r232A2RTT5 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vmn1r232A2RTT5 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vmn1r232A2RTT5 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vmn1r232A2RTT5 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vmn1r232A2RTT5 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vmn1r232A2RTT5 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vmn1r232A2RTT5 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vmn1r232A2RTT5 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vmn1r232A2RTT5 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vmn1r232A2RTT5 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vmn1r232A2RTT5 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vmn1r232A2RTT5 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Vmn1r232A2RTT5 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vmn1r232A2RTT5 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vmn1r232A2RTT5 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vmn1r232A2RTT5 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Vmn1r232A2RTT5 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vmn1r232A2RTT5 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vmn1r232A2RTT5 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vmn1r232A2RTT5 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vmn1r232A2RTT5 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vmn1r232A2RTT5 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vmn1r232A2RTT5 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vmn1r232A2RTT5 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vmn1r232A2RTT5 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vmn1r232A2RTT5 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vmn1r232A2RTT5 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vmn1r232A2RTT5 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vmn1r232A2RTT5 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vmn1r232A2RTT5 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vmn1r232A2RTT5 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vmn1r232A2RTT5 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vmn1r232A2RTT5 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vmn1r232A2RTT5 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vmn1r232A2RTT5 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vmn1r232A2RTT5 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vmn1r232A2RTT5 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Vmn1r232A2RTT5 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vmn1r232A2RTT5 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vmn1r232A2RTT5 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vmn1r232A2RTT5 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vmn1r232A2RTT5 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vmn1r232A2RTT5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vmn1r232A2RTT5 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vmn1r232A2RTT5 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 279.8 ms