Protein–RNA interactions for Protein: A2AV25

Fibcd1, Fibrinogen C domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fibcd1A2AV25 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fibcd1A2AV25 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fibcd1A2AV25 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fibcd1A2AV25 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fibcd1A2AV25 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Fibcd1A2AV25 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fibcd1A2AV25 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fibcd1A2AV25 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fibcd1A2AV25 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fibcd1A2AV25 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fibcd1A2AV25 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fibcd1A2AV25 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fibcd1A2AV25 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fibcd1A2AV25 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fibcd1A2AV25 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fibcd1A2AV25 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fibcd1A2AV25 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fibcd1A2AV25 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fibcd1A2AV25 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Fibcd1A2AV25 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fibcd1A2AV25 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fibcd1A2AV25 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fibcd1A2AV25 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fibcd1A2AV25 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fibcd1A2AV25 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fibcd1A2AV25 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fibcd1A2AV25 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fibcd1A2AV25 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fibcd1A2AV25 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fibcd1A2AV25 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fibcd1A2AV25 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fibcd1A2AV25 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fibcd1A2AV25 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fibcd1A2AV25 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fibcd1A2AV25 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fibcd1A2AV25 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fibcd1A2AV25 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fibcd1A2AV25 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fibcd1A2AV25 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fibcd1A2AV25 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fibcd1A2AV25 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fibcd1A2AV25 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fibcd1A2AV25 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fibcd1A2AV25 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fibcd1A2AV25 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fibcd1A2AV25 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fibcd1A2AV25 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fibcd1A2AV25 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fibcd1A2AV25 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fibcd1A2AV25 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fibcd1A2AV25 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fibcd1A2AV25 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fibcd1A2AV25 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fibcd1A2AV25 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fibcd1A2AV25 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fibcd1A2AV25 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fibcd1A2AV25 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Fibcd1A2AV25 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fibcd1A2AV25 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Fibcd1A2AV25 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fibcd1A2AV25 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fibcd1A2AV25 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fibcd1A2AV25 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fibcd1A2AV25 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fibcd1A2AV25 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fibcd1A2AV25 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fibcd1A2AV25 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fibcd1A2AV25 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fibcd1A2AV25 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fibcd1A2AV25 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fibcd1A2AV25 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fibcd1A2AV25 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fibcd1A2AV25 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fibcd1A2AV25 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fibcd1A2AV25 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Fibcd1A2AV25 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fibcd1A2AV25 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fibcd1A2AV25 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Fibcd1A2AV25 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Fibcd1A2AV25 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fibcd1A2AV25 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fibcd1A2AV25 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Fibcd1A2AV25 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fibcd1A2AV25 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fibcd1A2AV25 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fibcd1A2AV25 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fibcd1A2AV25 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fibcd1A2AV25 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fibcd1A2AV25 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fibcd1A2AV25 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fibcd1A2AV25 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fibcd1A2AV25 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fibcd1A2AV25 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fibcd1A2AV25 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fibcd1A2AV25 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fibcd1A2AV25 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fibcd1A2AV25 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fibcd1A2AV25 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fibcd1A2AV25 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fibcd1A2AV25 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms