Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1H1

Trbv12-2, T cell receptor beta, variable 12-2 (Fragment), mousemouse

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Length 124 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trbv12-2A0A0B4J1H1 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trbv12-2A0A0B4J1H1 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trbv12-2A0A0B4J1H1 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trbv12-2A0A0B4J1H1 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trbv12-2A0A0B4J1H1 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trbv12-2A0A0B4J1H1 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trbv12-2A0A0B4J1H1 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
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