Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WR25

Gm28360, Predicted gene 28360, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28360A0A087WR25 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm28360A0A087WR25 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm28360A0A087WR25 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm28360A0A087WR25 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm28360A0A087WR25 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm28360A0A087WR25 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm28360A0A087WR25 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm28360A0A087WR25 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm28360A0A087WR25 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm28360A0A087WR25 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm28360A0A087WR25 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm28360A0A087WR25 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm28360A0A087WR25 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm28360A0A087WR25 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm28360A0A087WR25 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm28360A0A087WR25 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm28360A0A087WR25 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm28360A0A087WR25 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm28360A0A087WR25 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm28360A0A087WR25 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm28360A0A087WR25 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm28360A0A087WR25 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm28360A0A087WR25 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm28360A0A087WR25 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm28360A0A087WR25 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm28360A0A087WR25 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm28360A0A087WR25 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm28360A0A087WR25 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm28360A0A087WR25 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm28360A0A087WR25 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm28360A0A087WR25 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm28360A0A087WR25 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm28360A0A087WR25 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm28360A0A087WR25 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm28360A0A087WR25 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm28360A0A087WR25 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm28360A0A087WR25 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm28360A0A087WR25 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gm28360A0A087WR25 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gm28360A0A087WR25 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Gm28360A0A087WR25 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gm28360A0A087WR25 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm28360A0A087WR25 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm28360A0A087WR25 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm28360A0A087WR25 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm28360A0A087WR25 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm28360A0A087WR25 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm28360A0A087WR25 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm28360A0A087WR25 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm28360A0A087WR25 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm28360A0A087WR25 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm28360A0A087WR25 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm28360A0A087WR25 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm28360A0A087WR25 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm28360A0A087WR25 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm28360A0A087WR25 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm28360A0A087WR25 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm28360A0A087WR25 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm28360A0A087WR25 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm28360A0A087WR25 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm28360A0A087WR25 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm28360A0A087WR25 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm28360A0A087WR25 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm28360A0A087WR25 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm28360A0A087WR25 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm28360A0A087WR25 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm28360A0A087WR25 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm28360A0A087WR25 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm28360A0A087WR25 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm28360A0A087WR25 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm28360A0A087WR25 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm28360A0A087WR25 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm28360A0A087WR25 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm28360A0A087WR25 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm28360A0A087WR25 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm28360A0A087WR25 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gm28360A0A087WR25 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm28360A0A087WR25 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm28360A0A087WR25 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm28360A0A087WR25 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm28360A0A087WR25 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm28360A0A087WR25 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm28360A0A087WR25 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm28360A0A087WR25 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm28360A0A087WR25 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm28360A0A087WR25 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm28360A0A087WR25 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm28360A0A087WR25 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm28360A0A087WR25 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm28360A0A087WR25 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm28360A0A087WR25 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm28360A0A087WR25 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm28360A0A087WR25 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm28360A0A087WR25 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm28360A0A087WR25 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm28360A0A087WR25 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm28360A0A087WR25 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm28360A0A087WR25 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm28360A0A087WR25 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm28360A0A087WR25 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
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