Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B5J4

Trbc2, T cell receptor beta, constant 2 (Fragment), mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbc2A0A075B5J4 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trbc2A0A075B5J4 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trbc2A0A075B5J4 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trbc2A0A075B5J4 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trbc2A0A075B5J4 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Trbc2A0A075B5J4 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trbc2A0A075B5J4 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trbc2A0A075B5J4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trbc2A0A075B5J4 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Trbc2A0A075B5J4 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trbc2A0A075B5J4 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trbc2A0A075B5J4 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trbc2A0A075B5J4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trbc2A0A075B5J4 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trbc2A0A075B5J4 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trbc2A0A075B5J4 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trbc2A0A075B5J4 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trbc2A0A075B5J4 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trbc2A0A075B5J4 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trbc2A0A075B5J4 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trbc2A0A075B5J4 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trbc2A0A075B5J4 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Trbc2A0A075B5J4 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Trbc2A0A075B5J4 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trbc2A0A075B5J4 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trbc2A0A075B5J4 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trbc2A0A075B5J4 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trbc2A0A075B5J4 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trbc2A0A075B5J4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trbc2A0A075B5J4 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Trbc2A0A075B5J4 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trbc2A0A075B5J4 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trbc2A0A075B5J4 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trbc2A0A075B5J4 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trbc2A0A075B5J4 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trbc2A0A075B5J4 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trbc2A0A075B5J4 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trbc2A0A075B5J4 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trbc2A0A075B5J4 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trbc2A0A075B5J4 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trbc2A0A075B5J4 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trbc2A0A075B5J4 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trbc2A0A075B5J4 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trbc2A0A075B5J4 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trbc2A0A075B5J4 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trbc2A0A075B5J4 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trbc2A0A075B5J4 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Trbc2A0A075B5J4 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trbc2A0A075B5J4 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trbc2A0A075B5J4 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trbc2A0A075B5J4 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trbc2A0A075B5J4 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trbc2A0A075B5J4 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trbc2A0A075B5J4 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Trbc2A0A075B5J4 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trbc2A0A075B5J4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trbc2A0A075B5J4 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trbc2A0A075B5J4 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trbc2A0A075B5J4 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trbc2A0A075B5J4 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trbc2A0A075B5J4 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trbc2A0A075B5J4 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trbc2A0A075B5J4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trbc2A0A075B5J4 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Trbc2A0A075B5J4 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Trbc2A0A075B5J4 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trbc2A0A075B5J4 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trbc2A0A075B5J4 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trbc2A0A075B5J4 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trbc2A0A075B5J4 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trbc2A0A075B5J4 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trbc2A0A075B5J4 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trbc2A0A075B5J4 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trbc2A0A075B5J4 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trbc2A0A075B5J4 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trbc2A0A075B5J4 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trbc2A0A075B5J4 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trbc2A0A075B5J4 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trbc2A0A075B5J4 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trbc2A0A075B5J4 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trbc2A0A075B5J4 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trbc2A0A075B5J4 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trbc2A0A075B5J4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trbc2A0A075B5J4 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trbc2A0A075B5J4 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trbc2A0A075B5J4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trbc2A0A075B5J4 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trbc2A0A075B5J4 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trbc2A0A075B5J4 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trbc2A0A075B5J4 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trbc2A0A075B5J4 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trbc2A0A075B5J4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trbc2A0A075B5J4 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trbc2A0A075B5J4 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trbc2A0A075B5J4 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trbc2A0A075B5J4 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trbc2A0A075B5J4 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trbc2A0A075B5J4 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Trbc2A0A075B5J4 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trbc2A0A075B5J4 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
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