Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2E6

DTX4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX4Q9Y2E6 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms