Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3P4

VPS8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS8Q8N3P4 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
VPS8Q8N3P4 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
VPS8Q8N3P4 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
VPS8Q8N3P4 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
VPS8Q8N3P4 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
VPS8Q8N3P4 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
VPS8Q8N3P4 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
VPS8Q8N3P4 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
VPS8Q8N3P4 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
VPS8Q8N3P4 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
VPS8Q8N3P4 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
VPS8Q8N3P4 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
VPS8Q8N3P4 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
VPS8Q8N3P4 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
VPS8Q8N3P4 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
VPS8Q8N3P4 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
VPS8Q8N3P4 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
VPS8Q8N3P4 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
VPS8Q8N3P4 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
VPS8Q8N3P4 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
VPS8Q8N3P4 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
VPS8Q8N3P4 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
VPS8Q8N3P4 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
VPS8Q8N3P4 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
VPS8Q8N3P4 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
VPS8Q8N3P4 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
VPS8Q8N3P4 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
VPS8Q8N3P4 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
VPS8Q8N3P4 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
VPS8Q8N3P4 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
VPS8Q8N3P4 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
VPS8Q8N3P4 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
VPS8Q8N3P4 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
VPS8Q8N3P4 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
VPS8Q8N3P4 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
VPS8Q8N3P4 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
VPS8Q8N3P4 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
VPS8Q8N3P4 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
VPS8Q8N3P4 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
VPS8Q8N3P4 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
VPS8Q8N3P4 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
VPS8Q8N3P4 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
VPS8Q8N3P4 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
VPS8Q8N3P4 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
VPS8Q8N3P4 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
VPS8Q8N3P4 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
VPS8Q8N3P4 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
VPS8Q8N3P4 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
VPS8Q8N3P4 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
VPS8Q8N3P4 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
VPS8Q8N3P4 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
VPS8Q8N3P4 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
VPS8Q8N3P4 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
VPS8Q8N3P4 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
VPS8Q8N3P4 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
VPS8Q8N3P4 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
VPS8Q8N3P4 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
VPS8Q8N3P4 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
VPS8Q8N3P4 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
VPS8Q8N3P4 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
VPS8Q8N3P4 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
VPS8Q8N3P4 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
VPS8Q8N3P4 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
VPS8Q8N3P4 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
VPS8Q8N3P4 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
VPS8Q8N3P4 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
VPS8Q8N3P4 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
VPS8Q8N3P4 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
VPS8Q8N3P4 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
VPS8Q8N3P4 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
VPS8Q8N3P4 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
VPS8Q8N3P4 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
VPS8Q8N3P4 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
VPS8Q8N3P4 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
VPS8Q8N3P4 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
VPS8Q8N3P4 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
VPS8Q8N3P4 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
VPS8Q8N3P4 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
VPS8Q8N3P4 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
VPS8Q8N3P4 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
VPS8Q8N3P4 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
VPS8Q8N3P4 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
VPS8Q8N3P4 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
VPS8Q8N3P4 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
VPS8Q8N3P4 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
VPS8Q8N3P4 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
VPS8Q8N3P4 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
VPS8Q8N3P4 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
VPS8Q8N3P4 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
VPS8Q8N3P4 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
VPS8Q8N3P4 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
VPS8Q8N3P4 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
VPS8Q8N3P4 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
VPS8Q8N3P4 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
VPS8Q8N3P4 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
VPS8Q8N3P4 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
VPS8Q8N3P4 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
VPS8Q8N3P4 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
VPS8Q8N3P4 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
VPS8Q8N3P4 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms