Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC9.97□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms