Protein–RNA interactions for Protein: Q3UM29

Cog7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog7Q3UM29 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cog7Q3UM29 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cog7Q3UM29 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Cog7Q3UM29 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cog7Q3UM29 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cog7Q3UM29 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cog7Q3UM29 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cog7Q3UM29 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cog7Q3UM29 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cog7Q3UM29 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cog7Q3UM29 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Cog7Q3UM29 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cog7Q3UM29 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cog7Q3UM29 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cog7Q3UM29 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Cog7Q3UM29 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cog7Q3UM29 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cog7Q3UM29 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cog7Q3UM29 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cog7Q3UM29 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cog7Q3UM29 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cog7Q3UM29 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cog7Q3UM29 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cog7Q3UM29 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cog7Q3UM29 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cog7Q3UM29 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cog7Q3UM29 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cog7Q3UM29 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cog7Q3UM29 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Cog7Q3UM29 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cog7Q3UM29 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cog7Q3UM29 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Cog7Q3UM29 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cog7Q3UM29 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cog7Q3UM29 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cog7Q3UM29 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cog7Q3UM29 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cog7Q3UM29 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cog7Q3UM29 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cog7Q3UM29 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cog7Q3UM29 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cog7Q3UM29 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cog7Q3UM29 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Cog7Q3UM29 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cog7Q3UM29 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cog7Q3UM29 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cog7Q3UM29 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cog7Q3UM29 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cog7Q3UM29 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Cog7Q3UM29 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cog7Q3UM29 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cog7Q3UM29 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cog7Q3UM29 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cog7Q3UM29 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cog7Q3UM29 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cog7Q3UM29 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cog7Q3UM29 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cog7Q3UM29 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cog7Q3UM29 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cog7Q3UM29 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cog7Q3UM29 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cog7Q3UM29 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cog7Q3UM29 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cog7Q3UM29 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cog7Q3UM29 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cog7Q3UM29 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cog7Q3UM29 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cog7Q3UM29 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cog7Q3UM29 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cog7Q3UM29 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cog7Q3UM29 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cog7Q3UM29 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Cog7Q3UM29 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cog7Q3UM29 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cog7Q3UM29 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cog7Q3UM29 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.04■□□□□ -0
Cog7Q3UM29 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cog7Q3UM29 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cog7Q3UM29 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cog7Q3UM29 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cog7Q3UM29 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cog7Q3UM29 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cog7Q3UM29 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cog7Q3UM29 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cog7Q3UM29 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cog7Q3UM29 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cog7Q3UM29 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cog7Q3UM29 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cog7Q3UM29 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cog7Q3UM29 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cog7Q3UM29 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cog7Q3UM29 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cog7Q3UM29 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cog7Q3UM29 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cog7Q3UM29 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cog7Q3UM29 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cog7Q3UM29 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cog7Q3UM29 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cog7Q3UM29 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cog7Q3UM29 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms