Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd13P70217 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd13P70217 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd13P70217 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd13P70217 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd13P70217 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd13P70217 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd13P70217 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd13P70217 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd13P70217 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd13P70217 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd13P70217 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd13P70217 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd13P70217 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd13P70217 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd13P70217 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd13P70217 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd13P70217 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Hoxd13P70217 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxd13P70217 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxd13P70217 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxd13P70217 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxd13P70217 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxd13P70217 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxd13P70217 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxd13P70217 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxd13P70217 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxd13P70217 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxd13P70217 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxd13P70217 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxd13P70217 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxd13P70217 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
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Hoxd13P70217 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxd13P70217 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxd13P70217 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxd13P70217 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
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Hoxd13P70217 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxd13P70217 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Hoxd13P70217 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxd13P70217 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Hoxd13P70217 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxd13P70217 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxd13P70217 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxd13P70217 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxd13P70217 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxd13P70217 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hoxd13P70217 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hoxd13P70217 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hoxd13P70217 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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Hoxd13P70217 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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Hoxd13P70217 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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Hoxd13P70217 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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Hoxd13P70217 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxd13P70217 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxd13P70217 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Hoxd13P70217 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Hoxd13P70217 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxd13P70217 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxd13P70217 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxd13P70217 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxd13P70217 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxd13P70217 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxd13P70217 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxd13P70217 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxd13P70217 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxd13P70217 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxd13P70217 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxd13P70217 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxd13P70217 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Hoxd13P70217 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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