Protein–RNA interactions for Protein: P31257

Hoxc10, Homeobox protein Hox-C10, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc10P31257 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxc10P31257 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxc10P31257 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxc10P31257 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxc10P31257 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxc10P31257 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxc10P31257 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxc10P31257 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxc10P31257 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxc10P31257 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxc10P31257 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxc10P31257 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxc10P31257 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxc10P31257 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxc10P31257 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxc10P31257 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxc10P31257 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxc10P31257 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxc10P31257 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxc10P31257 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxc10P31257 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxc10P31257 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxc10P31257 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxc10P31257 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxc10P31257 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxc10P31257 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxc10P31257 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxc10P31257 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxc10P31257 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxc10P31257 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxc10P31257 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxc10P31257 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxc10P31257 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxc10P31257 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxc10P31257 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxc10P31257 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxc10P31257 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxc10P31257 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxc10P31257 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxc10P31257 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxc10P31257 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxc10P31257 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxc10P31257 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxc10P31257 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxc10P31257 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxc10P31257 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxc10P31257 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxc10P31257 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxc10P31257 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxc10P31257 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxc10P31257 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxc10P31257 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxc10P31257 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxc10P31257 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxc10P31257 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxc10P31257 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxc10P31257 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxc10P31257 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxc10P31257 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxc10P31257 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxc10P31257 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxc10P31257 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxc10P31257 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxc10P31257 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxc10P31257 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxc10P31257 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxc10P31257 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxc10P31257 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxc10P31257 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxc10P31257 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxc10P31257 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxc10P31257 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxc10P31257 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxc10P31257 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxc10P31257 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxc10P31257 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxc10P31257 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxc10P31257 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxc10P31257 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxc10P31257 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxc10P31257 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxc10P31257 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxc10P31257 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxc10P31257 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxc10P31257 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxc10P31257 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxc10P31257 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hoxc10P31257 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hoxc10P31257 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hoxc10P31257 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hoxc10P31257 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hoxc10P31257 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hoxc10P31257 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hoxc10P31257 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hoxc10P31257 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxc10P31257 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxc10P31257 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxc10P31257 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxc10P31257 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxc10P31257 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms